| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| がんばれゴエモンのテーマ | ゴエモン制作委員会 | オープニングテーマ フルサイズ 歌：影山ヒロノブ |
第2回ゲームソング521位 第2回オープニング231位 |
| おれはインパクト | 搭乗デモBGM フルサイズ 歌：水木一郎 |
第12回878位 第16回666位 ゲームソング53位 第2回ゲームソング76位 第3回ゲームソング81位 1990年代153位 N64 35位 | |
| ふじやま道中は旅のはじまり | 甲斐「街道」、日本一の山「富士山」、信濃～伊賀 | 一面195位 N64 110位 | |
| 花の大江戸はぐれ町 | はぐれ町、各所屋内 | ||
| プラズマおやぢの秘密 | 占い屋 | ||
| 待ってな!今行くぜい! | はぐれ街～大江戸城の道、三重の塔（大和） | ||
| 殿様救出大作戦! | かいぞう大江戸城 | KONAMI32位 和風83位 ダンジョン238位 N64 44位 | |
| 妖艶!かりふらわー | オカマ幹部４人衆のテーマ | ||
| やけどに注意 | 大江戸城ボス「コンゴウ」戦 | ||
| 楽勝Get A Way | 重要アイテム・術獲得 | ||
| warriors | 巨大ボスその１「カシワギ」戦、巨大ボスその２「タイサンバ２」戦 | ||
| 朱に交われば禅の心 | 山代「ざぜん町」 | 町曲94位 和風195位 癒し187位 | |
| ヤマトナデシコタビノハナ | 大和 | N64 64位 | |
| いにしえバンブー | 竹やぶ | ||
| 胸キュンボサノバ | 大江戸ツーリスト | ||
| たそがれ小竜太 | 小竜太のテーマ | ||
| 逢いたくて未練階段 | 讃岐「こんぴら山」 後半に民謡「金毘羅船々」のメロディが使われている |
N64 125位 | |
| 夕焼けWant you | 四国地方道中 | 第2回76位 第6回664位 第11回614位 第15回460位 第17回553位 和風134位 歴代256位 1990年代74位 N64 29位 | |
| あなたの後ろに郷土玩具 | ゴーストおもちゃ城 | ||
| ハートブレイクコロリン | おもちゃ城ボス「ダルマーニョ」戦 | N64 143位 ボス戦195位 | |
| 高飛車マーチ | 弾神＆蘭子のテーマ | ||
| 農村物語 | 阿波「えらやっちゃ村」（おもちゃ城クリア後） | ||
| うどんこたろう | 中国地方道中 | ||
| 神様の大きな木 | 出雲２（出雲大社） | ||
| こころの電池 | サスケ復活 | ||
| 火炎狐に氷の刃 | フェスティバルてんぷる城 | ||
| オニオニランデブー | ゲームオーバー | ||
| ぶっちぎり万歳! | 対ベンケイ戦、修行中（ゴエモン・サスケ） | ||
| 雪どけは祭りとともに | 陸奥「おまつり村」 | 第3回450位 和風309位 冬・雪・氷76位 N64 120位 | |
| 深々揺々白い影 | 恐山・海岸線（陸奥） | 冬・雪・氷282位 N64 104位 | |
| ふわふわマーメイド | 日本海海中 | ||
| 熱血マン | ぐるめちっくサブまりん城 | 第7回227位 第8回965位 KONAMI43位 和風131位 ダンジョン395位 N64 43位 | |
| まん中池の妖怪 | カッパのキハチのテーマ | ||
| 聖地ペモペモ | 羽後「すとーんさーくる」 | ||
| カブキング | ゴージャスミュージカル城前半部 | KONAMI43位 和風189位 N64 75位 | |
| そげんすとりぃと | そげん町 | ||
| Goe Goe Spark | ゴージャスミュージカル城後半部 | ||
| Little Baby Sleepin' | 巨大ボスその３「バルベラ」戦 | ||
| DarkデBadナEasyヨ! | 最終ボス「ド・エトワール」戦 | ||
| 平和ですぅ! | エンディング１ | ||
| んなあほな | エンディング２ | ||
| やったぜ天晴れ日本晴れ | スタッフロール 『3』のスタッフロール曲のアレンジ アレンジ版となっておりゲーム版と若干の相違点がある。 |
第2回エンディング218位 | |
| ゴージャス・マイ・ステージ | ゴエモン制作委員会（冨田朋也？） | ミュージカル城ボスイベント挿入歌 歌：太田悦世 立花敏弘 再アレンジ・再録版のため、ゲーム版とは音源が異なる |
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| おれはインパクト ～ Momoyama Mix 1997 | ゴエモン制作委員会 | ボーナストラック 歌：水木一郎 |
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| 未収録曲(一部仮曲名) | |||
| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| オープニング | エビス丸のはだか踊り～襲来～一大事 | ||
| ゴエモン長屋 | はぐれ町（チェーンキセル取得まで） 「がんばれゴエモンのテーマ」のアレンジ |
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| との様・ゆき姫のテーマ | 改造大江戸城クリア後デモ ゆき姫救出絵巻「天下のボヨヨンコンビ」のアレンジ |
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| インパクト搭乗デモ～高速アクションステージ | 『おれはインパクト』高速アクションステージ版 ※1番の後歌なしのメロディのみ繰り返される |
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| 勝利のテーマ | インパクト戦クリア | ||
| くのいち参上 | ヤエのテーマ | ||
| コントロールマシン | 龍暴走 | ||
| 忍び寄る影 | えらやっちゃ村(城クリア前) | ||
| おやかたのテーマ | 修行・エビス丸 | ||
| 砂の迷宮 | 因幡砂丘 | ||
| 秋芳洞 | てんぷる城へ続く洞窟 | ||
| ハートブレイクコロリン(ツラミ戦) | |||
| おみつのテーマ | おみっちゃん再会 | ||
| 消えた九州 | 九州消失イベント | ||
| 浮気な師範代PART3 | 修行・ゴエモン&ヤエ 『3』の道場BGMより |
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| イタコばあさんの家 | イタコの家 | ||
| やったぜ天晴れ日本晴れ | ゲーム音源版 | ||
| ゴージャスマイステージ | |||
