| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| SMILE AGAIN (テーマソング) | ゴエモン制作委員会 | テーマソング 歌：影山ヒロノブ 「ゴエモン音楽集・白」では「(テーマソング)」の表記が無い |
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| 白いブラウス (セレクト) | 旅日記＆キャラセレクト 「ゴエモン音楽集・白」では「(セレクト)」の表記が無い |
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| オープニングその1 | オープニング (物知りじいさんの招待) 原曲：ネオ桃山幕府「さあ行くぜ！ (ゴエモン長屋)」 |
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| オープニングその2 | オープニング (召還マシンお披露目) | ||
| オープニングその3 | オープニング (ビスマル再来、一大事) 原曲：がんばれゴエモン3「オープニングデモ」(ビスマル登場以降) |
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| 寿 (エリアタイトル) | エリアタイトル | ||
| 地図夫 (大マップ) | エリアマップ (ステージセレクト) 原曲：ネオ桃山幕府「ふじやま道中は旅のはじまり (甲斐～伊賀の道中)」 |
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| ウマ夫 (はぐれ街道) | はぐれ街道 (昼) 「ゴエモン音楽集・白」では下記の「夜露に濡れて… (大江戸エリア道中夜)」とのメドレー形式にして一曲となっている |
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| 夜露に濡れて… (大江戸エリア道中夜) | 大江戸エリア道中 (夜) 「ゴエモン音楽集・白」では上記の「ウマ夫 (はぐれ街道)」とのメドレー形式にして一曲となっている |
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| 楽勝 Get a Way (手形ゲット) | 原曲：ネオ桃山幕府「楽勝 Get a Way (アイテム・ゲット)」 | ||
| 犬も歩けばはぐれ町 (はぐれ町) | はぐれ町 | ||
| こころの電池PART2 (サスケ登場) | |||
| ちぇっきらう (ビートマニアのお願い) | ビートマニアの依頼 | ||
| ポンポンのおいしい水 (ほれほれ金山) | ほれほれ金山 | ||
| 骨身に染みるナァ (ガシャドクロ戦) | がしゃどくろ (中ボス)戦 | ||
| 次いってみよう (つちころび退治) | つちころび退治 | ||
| 人類への警鐘 (かねつき峠) | かねつき峠 | ||
| タヌ夫 (ゴールタヌキ) | ゴエモン制作委員会 | ゴールタヌキ (ステージ再クリア) 原曲：奇天烈将軍マッギネス『たぬきでがっぽり (ステージクリアー)』 |
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| ビザが必要です (関所) | 関所 | ||
| ぷーぷぷっぷっぷ (インパクト暴走) | エリア1中間デモ1 | ||
| Burning My Soul (大江戸城) | 大江戸城、夢幻城 (その１) | 第5回782位 第6回586位 第7回353位 和風39位 第2回和風11位 横スクロール94位 N64 18位 | |
| 孤高の戦士 (ししかかし登場～城ボス戦) | シシカカシ登場〜シシカカシ戦 | ||
| お前のものも俺のもの (おみっちゃん救出) | エリア1中間デモ2 (おみっちゃん救出) 原曲：ネオ桃山幕府「おだんご出前タフガール (おみっちゃん登場)」 |
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| 最新メカ飛来 | エリア1中間デモ2 (ダブル・インパクト飛来) 「ゴエモン音楽集・白」では下記の「物知りジジイの野望 (物知りじいさん)」とのメドレー形式にして一曲となっている |
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| 物知りジジイの野望 (物知りじいさん) | エリア1中間デモ2 (物知りじいさん登場) 「ゴエモン音楽集・白」では上記の「最新メカ飛来」とのメドレー形式にして一曲となっている |
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| ダブル・インパクト (インパクト搭乗) | ゴエモン制作委員会 | インパクト搭乗デモ 歌：水木一郎 「ゴエモン音楽集・白」未収録曲 |
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| デカイ！デカすぎる！ (巨大ボス戦) | |||
| トゥービーコンティニュードザマス (ビスマルポッド) | 原曲：がんばれゴエモン3「シスタービスマルのテーマ」 | ||
| やったぜ！ジュテーム (エリアクリア) | |||
| 大江戸のふたり (大江戸クリア) | 大江戸城エリアクリア 原曲：ネオ桃山幕府「いつものふたり (殿様ゆき姫救出後)」 |
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| さすらい道中カッパ旅 (カッパ街道) | カッパ街道 | ||
| 人は水から生まれました河童編 (カッパ街道水中) | |||
| 再見！ (カエル山) | カエル山 (昼) 「ゴエモン音楽集・白」では下記の「カエルそしてカエル (竜宮エリア道中夜)」とのメドレー形式にして一曲となっている |
和風289位 横スクロール127位 第2回掘り出し90位 N64 106位 | |
| カエルそしてカエル (竜宮エリア道中夜) | 竜宮エリア道中 (夜) 「ゴエモン音楽集・白」では上記の「再見！ (カエル山)」とのメドレー形式にして一曲となっている |
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| リゾート気分でいらっしゃい (乙姫町) | 乙姫町 | ||
| くノ一たはむれ (ヤエちゃん登場) | ヤエ登場 | ||
| これもプラズマで説明できます (占い屋) | 占い屋 原曲：ネオ桃山幕府「プラズマおやぢの秘密 (占い屋)」 |
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| ライバルよ永遠(とわ)に！ (おいかけっこ) | オビス丸と競争 | ||
| 愛ゆえに… (ナルト街道) | ナルト街道 | ||
| 人は水から生まれました (ナルト街道水中) | ナルト街道水中 | ||
| 亀上的竜宮生活 (竜宮城) | 竜宮城、夢幻城 (その2) | 第3回593位 第4回492位 第6回541位 第7回712位 第9回766位 第11回682位 第13回692位 第19回558位 和風40位 第2回和風28位 横スクロール33位 夏67位 1990年代63位 N64 16位 | |
| 美しさは大罪 (ビスマルのテーマ) | 竜宮城 中ボス戦前会話 原曲：がんばれゴエモン3「シスタービスマルのテーマ」 |
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| どこへ向かうか作戦会議 ～ スザク登場 (竜宮城エリアクリア) | 竜宮城エリアクリア | ||
| SMILE AGAIN (Fullサイズ) | ゴエモン制作委員会 | SMILE AGAIN (Fullサイズ) 歌：影山ヒロノブ |
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| SMILE AGAIN-karaoke- | SMILE AGAIN (カラオケバージョン) | ||
| ダブル・インパクト-karaoke- | ダブル・インパクト (カラオケバージョン) | ||
| 電動地獄 (こけし道中) | こけし道中 「ゴエモン音楽集・白」では下記の「ナイトクラブへようこそ (魔封エリア道中夜)」とのメドレー形式にして一曲となっている |
N64 137位 | |
| ナイトクラブへようこそ (魔封エリア道中夜) | 魔封島エリア道中 (夜) 「ゴエモン音楽集・白」では上記の「電動地獄 (こけし道中)」とのメドレー形式にして一曲となっている |
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| こりゃやべーよ (人くい街道) | 人食い街道 | ||
| 洞窟探検隊は見た (ぽちゃん湖) | ぽちゃん湖 | ||
| 怪しの人情模様 (怪奇村) | 怪奇村 | ||
| 宿屋松 | 宿泊中 (ゴエモン・エビス丸・ヤエ) 原曲：バッハ『G線上のアリア』より |
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| 大車輪を駆け抜けて (お墓峠) | お墓峠 | ||
| サンシロウ (魔人城) | 安慶名伸行 | 魔人城、夢幻城(その3) | 第6回661位 第7回589位 第9回834位 第14回781位 第15回977位 第16回841位 第17回772位 KONAMI188位 和風78位 第2回和風27位 横スクロール64位 1990年代255位 N64 26位 |
| 酒よ (ドウチュウ鬼復活) | 魔封島エリアクリア～ドウチュウ鬼復活 | ||
| オニ127％ (ゲームオーバー) | ゲームオーバー 原曲：ネオ桃山幕府「オニオニランデブー (ゲームオーバー)」 |
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| 生えてきちょる(かいわれ道中) | かいわれ道中 | ||
| あたしのとなりはトロロくん (もけけの森) | もけけの森 「ゴエモン音楽集・白」では下記の「幻想七転八起 (地底界エリア道中夜)」とのメドレー形式にして一曲となっている |
KONAMI188位 和風300位 第2回和風143位 癒し205位 | |
| 幻想七転八起 (地底界エリア道中夜) | 地底界エリア道中 (夜) 「ゴエモン音楽集・白」では上記の「あたしのとなりはトロロくん (もけけの森)」とのメドレー形式にして一曲となっている |
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| 当社比2.2倍の難度～ガンコオヤジ～ (迷い谷) | 迷い谷 | ||
| 3500両の恐怖 (キリカブ村) | キリカブ村 | ||
| 宿屋松 (サスケバージョン) | 宿泊中 (サスケ) 原曲：ネオ桃山幕府「がんばれゴエモンのテーマ」 |
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| 地図に載ってないで (でろでろ村昼) | でろでろ村 | ||
| 地底の落園 (地底城) | 地底城、夢幻城(その4) | 第15回636位 第16回492位 KONAMI92位 掘り出し22位 1990年代223位 N64 115位 | |
| 復讐の戦士・ここであったが百年目 (カブキ64登場) | カブキ64戦前 | ||
| 次期主役候補 (地底界エリアクリア) | 地底界エリアクリア | ||
| 熱烈ホーニーマン (雲のとりで) | 雲のとりで 「ゴエモン音楽集・白」では下記の「ぬるぬるマンドリル (浮遊城エリア道中夜)」とのメドレー形式にして一曲となっている |
第3回305位 第7回585位 和風140位 第2回和風187位 横スクロール145位 掘り出し93位 N64 56位 | |
| ぬるぬるマンドリル (浮遊城エリア道中夜) | 浮遊城エリア道中 (夜) 「ゴエモン音楽集・白」では上記の「熱烈ホーニーマン (雲のとりで)」とのメドレー形式にして一曲となっている |
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| 水にも潜れます (空中庭園) | 空中庭園 | 第2回和風235位 | |
| ウキウキラプソディ (浮世町) | 浮世町 | 第2回和風187位 | |
| ときめきの予感 (電話相談室) | |||
| うなれ！疾風のわらじ (風の城壁) | 風の城壁 | ||
| DEATHです。 (最終巨大ボス戦) | デヴィル死神戦 | ||
| なんじゃこりゃ！？ (ドウチュウ鬼戦その1) | ドウチュウ鬼戦前半 | ||
| ちんちん・こうしちゃん (ドウチュウ鬼戦その2) | ドウチュウ鬼戦後半 (ファイナルバトル) | KONAMI188位 | |
| キショー天ケツ (浮遊城エリアクリアその1) | 浮遊城エリアクリア1 | ||
| THE POWER OF NICE SMELL (浮遊城エリアクリアその2) | 浮遊城エリアクリア2 | ||
| ザ・たそがれ’98 (浮遊城エリアクリアその3) | エンディング | ||
| こまったさん (エンディングその1) | エピローグ1 | ||
| くそがき (エンディングその2) | エピローグ2 | ||
| 悪戯 (エンディングその3) | エピローグ3 | ||
| やったぜ天晴れ日本晴れ (スタッフロール) | スタッフロール 原曲：ネオ桃山幕府「やったぜ天晴れ日本晴れ」 |
第2回エンディング206位 | |
| サントラ未収録曲 | |||
| おれはインパクト (激走インパクトステージ/インストver.) | インパクト搭乗後のミス・インパクト解説デモ(*1) 前作の流用 |
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*1 この曲がかかる部分は搭乗デモシーンが終わった後にすぐに戦闘に移ってしまい、サントラでも同様に１コーラスが終わった直後にフェードアウトして終わってしまうが、データ上は残りの部分も演奏されている。
