| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| タイトル（大海原） | タイトル画面、大海原BGM | NDS330位 | |
| メニューセレクト | |||
| 紙芝居（はじまり） | プロローグ | ||
| 紙芝居（出会い） | |||
| 紙芝居（ゼルダ姫） | |||
| 紙芝居（魔王のたくらみ） | |||
| 紙芝居（勇者となった少年） | |||
| 紙芝居（旅立ち） | |||
| 海賊船 | |||
| 幽霊船 出現 | |||
| テトラの呼び声 | |||
| メルカ島（南部） | |||
| 家の中 | |||
| シーワンのテーマ | |||
| シーワンの剣術指南 | |||
| 小アイテムゲット | |||
| 洞窟内部 | |||
| ラインバックのテーマ | NDS421位 ゼルダ38位 | ||
| アイテムゲット（目が回る） | |||
| 占いの館 | |||
| 夢幻の砂時計ゲット | |||
| 海王の神殿 探索開始 | |||
| 迫り来るファントム | |||
| ファントムの一撃 | |||
| テリーショップ | |||
| 精霊のみなもとゲット | |||
| 幽霊船 接近 | |||
| 神殿内部 | |||
| 戦闘 | |||
| アイテムゲット | |||
| ボス戦 | |||
| 時の砂 出現 | |||
| 時の砂ゲット | |||
| 精霊開放 | |||
| 精霊救出 | |||
| ハートの器ゲット | |||
| メルカ島（北部） | |||
| 大砲ゲーム 説明 | |||
| 海上ボス | |||
| ゲームオーバー | |||
| 精霊救出？ | |||
| シーワンとの会話 | |||
| シエラの覚醒 | |||
| ジョリーン襲来 | |||
| 霧の海域 | |||
| テトラ発見 | |||
| 紙芝居（ベラムー） | |||
| リンクとテトラ | |||
| 新たな出航 | |||
| 大金ルピーゲット | |||
| ゴロン島 | |||
| ゴロン島 家の中 | |||
| ババルピーゲット | |||
| マジカルボックス | |||
| アイテムゲット？ | |||
| 夢幻のつるぎゲット | |||
| ベラムー戦 | |||
| ベラムー戦（取り戻した記憶） | |||
| テトラ復活 | |||
| テトラとの再会 | |||
| テトラ誘拐 | |||
| 生きていたベラムー | |||
| ベラムー戦（幽霊船） | |||
| しぶといベラムー | |||
| 捕らわれたラインバック | |||
| とりつかれたラインバック | |||
| ベラムー戦（ファントム） | |||
| 海王登場 | |||
| 海王との会話 | |||
| 最後の会話 | |||
| シエラとの別れ | |||
| スタッフクレジット | |||
| エピローグ | |||
| 通信対戦：開始 | |||
| 通信対戦：リンク操作 | |||
| 通信対戦：ファントムに倒された | |||
| 通信対戦：リンクを倒した | |||
| 通信対戦：勝利 | |||
| 通信対戦：敗北/引き分け | |||
| 通信対戦：結果 |
