| 曲名 | 補足 | 順位 |
| Disc1 | ||
| Theme「ATHENA」(Original BGM) | ||
| Ordinary(Original BGM) | ||
| Theme「拳崇」(Original BGM) | ||
| Dino-Aquarium(Original BGM) | ||
| Theme「アストライオス」(Original BGM) | ||
| Dance with Dinosaur(Original BGM) | ||
| 崩れゆく世界(Original BGM) | ||
| Theme「まさと」(Original BGM) | ||
| -STAFF ONLY-(Original BGM) | ||
| Encounter(Original BGM) | ||
| 1st Emergency-発動-(Original BGM) | ||
| Pressure(Original BGM) | ||
| Silent Subway(Original BGM) | ||
| 動かない列車(Original BGM) | ||
| 止まらない列車(Original BGM) | ||
| 2nd Emergency-別離-(Original BGM) | ||
| Countdown!(Original BGM) | ||
| a Vision(Original BGM) | ||
| 真実(Original BGM) | ||
| Extraordinary(Original BGM) | ||
| 3rd Emergency-決着-(Original BGM) | ||
| Escape(Original BGM) | ||
| 4th Emergency-WARM-(Original BGM) | ||
| WAD(Original BGM) | ||
| Theme「高沖」(Original BGM) | ||
| Level 5(Original BGM) | ||
| Final Emergency-決戦-(Original BGM) | ||
| Secret Emergency-正体-(Original BGM) | ||
| Epilogue(Original BGM) | ||
| 救うための能力(Original BGM) | ||
| Theme「あてなっち」(Original BGM) | ||
| Theme「ATHENA」(ボーナス・トラック1・アレンジ・ヴァージョン) | ||
| -STAFF ONLY-(ボーナス・トラック1・アレンジ・ヴァージョン) | ||
| 決戦(ボーナス・トラック1・アレンジ・ヴァージョン) | ||
| wannabe(ボーナス・トラック2) | ||
| Disc2 | ||
| 遺跡と高沖と祖体(ループデモ/Movie Section) | ||
| WAD研究所(オープニング/Movie Section) | ||
| 「覚醒 確認」(Movie Section) | ||
| 降り注ぐ本(Movie Section) | ||
| 理香との帰り道(Movie Section) | ||
| やっぱり来ない…(2章オープニング/Movie Section) | ||
| 突進(Movie Section) | ||
| Tereport(前半/Movie Section) | ||
| Tereport(後半/Movie Section) | ||
| 「君はそれをどう使う?」(Movie Section) | ||
| 大浸水(Movie Section) | ||
| 水門開放(Movie Section) | ||
| 理香が危ない!(Movie Section) | ||
| 恐竜撃退(Movie Section) | ||
| 理香との再会(3章オープニング/Movie Section) | ||
| 急停車(Movie Section) | ||
| 急発進(Movie Section) | ||
| 不気味な列車内(Movie Section) | ||
| アストライオスの挑発(Movie Section) | ||
| 別離(Movie Section) | ||
| 怯える理香(Movie Section) | ||
| 連結装置解除(Movie Section) | ||
| 現場検証(Movie Section) | ||
| 収容(4章オープニング/Movie Section) | ||
| 闇の中に現れるアテナ(Movie Section) | ||
| 真実を語るまさと(Movie Section) | ||
| 目覚め(Movie Section) | ||
| WARM(5章オープニング/Movie Section) | ||
| 屋上に佇むアテナ(Movie Section) | ||
| 自爆(Movie Section) | ||
| 突撃命令(Movie Section) | ||
| 逃げ惑うアテナ(Movie Section) | ||
| 執拗な追尾(Movie Section) | ||
| 再突撃命令(Movie Section) | ||
| アテナが危ない!(Movie Section) | ||
| 哀哭(Movie Section) | ||
| 三宮の独白(最終章オープニング/Movie Section) | ||
| 高沖とまさとの会話(Movie Section) | ||
| タンタロス(Movie Section) | ||
| 隠されたもの(Movie Section) | ||
| 崩壊，そして…(Movie Section) | ||
| 始業式(エンディング1/Movie Section) | ||
| 初老の男(エンディング2/Movie Section) | ||
| ゲームオーバー2章(テレポート失敗)(Movie Section) | ||
| ゲームオーバー2章(崩壊阻止失敗)(Movie Section) | ||
| ゲームオーバー2章(理香救出失敗)(Movie Section) | ||
| ゲームオーバー3章(暴走阻止失敗)(Movie Section) | ||
| ゲームオーバー5章(爆弾解除失敗)(Movie Section) | ||
| ゲームオーバー最終章(最終戦敗北)(Movie Section) | ||
| ゲームオーバー汎用1(ESP暴走)(Movie Section) | ||
