| No. | 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| 11 | Title | タイトル 「タイトルBGM」のアレンジ |
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| 12 | Menu | メニュー 「セレクト」のアレンジ |
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| 23 | Records | |||
| 00 | FEVER | 誰かの残りウイルス数が3つになるとテンポが速くなる (テンポアップ時のBGMの番号は下段に表記) |
N64 94位 | |
| 01 | ||||
| 02 | CHILL | |||
| 03 | ||||
| 04 | CUBE | 第2回マイナーゲーム342位 | ||
| 05 | ||||
| 06 | QUEQUE | |||
| 07 | ||||
| 10 | Story Mode 1 | ストーリーモード、STAGE1の幕間BGM | ||
| 20 | Story Mode 2 | ストーリーモード、STAGE2、4、6、9の幕間BGM | ||
| 19 | Story Mode 3 | ストーリーモード、STAGE3、5、7の幕間BGM | ||
| 21 | Story Mode 4 | ストーリーモード、STAGE8の幕間BGM | ||
| 08 | VS.Ruby | ストーリーモードでのRuby戦 誰かの残りウイルス数が3つになるとテンポが速くなる (テンポアップ時のBGMの番号は下段に表記) |
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| 09 | ||||
| 14 | You Win | 勝利 「Fever クリア」のアレンジ |
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| 15 | VS Clear | 勝利(対戦) | ||
| 16 | VS Clear (short) | 「VS Clear」の前奏部のみ | ||
| 17 | You Lose | 敗北 | ||
| 18 | You Lose (short) | 「You Lose」の前奏部のみ | ||
| 22 | Credits | スタッフロール | ||
| 13 | Let's Try Another Challenge | ストーリーモードクリア後 |
*1 ちなみに日本国内ではSFC向けの衛星データ受信サービス「サテラビュー」向けに「Dr.Mario」の部分のみをハイスコアアタックゲームとして配信された後、任天度パワー向けの単独配信作品としてリリースされた。こちらではBGMのアレンジが64版と微妙に異なる
