| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| 闘気 -ファイティングスピリッツ- | 森久保祥太郎 | オープニング＆エンディングテーマ 歌：竹内順子 |
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| 俺の忍道 | 赤西康彦 | タイトル画面 | |
| 出発の刻 | 谷謙治 | モード選択 | |
| いざ勝負!! | 南の森など | ||
| 荒野の戦い | 通常戦闘 | ||
| 湖上のバトル | 梵天沼 | ||
| 激闘開始 | 赤西康彦 | 如月村 | |
| 決戦 | |||
| チャクラ全開 | |||
| 天守閣の死闘 | |||
| 傀儡軍団の強襲 | 谷謙治 | 木の葉の里(襲撃時) | |
| 死闘・白銀三人衆との戦い | 白銀三人衆戦 | ||
| 究極傀儡を打ち倒せ！ | 赤西康彦 | ラスボス戦 | |
| 新天地をめざせ！ | 末廣誠 | マップ画面 | |
| おいでませ、忍具屋へ | 忍具屋 | ||
| 予感 | 赤西康彦 | ||
| ひとやすみ | 末廣誠 | ||
| 木ノ葉大門前 | 赤西康彦 | 木ノ葉大門前 | |
| 疑心暗鬼 | 末廣誠 | ||
| 策略 | 谷謙治 | ||
| 危機との対峙 | |||
| 白銀三人衆のテーマ | |||
| 宿命の訪れ | 末廣誠 | ||
| 闘気 -ファイティングスピリッツ-(インストゥルメンタル) | 森久保祥太郎 | ||
| サントラ未収録(仮曲名) | |||
| 海外版オープニングテーマ | 岡部啓一 | ||
| カカシ・ガイ戦 | |||
| イタチ・鬼鮫戦 | |||
| 海外版スタッフロール | 「俺の忍道」のロングバージョン | ||
