| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| PC-98版 | |||
| チャイム | 仮曲名 3DO版は未使用 「ウエストミンスターの鐘」 |
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| 卒業II攻略法 (インスト) | 仮曲名 PC98版のタイトル～教師名前登録～5人の自己紹介 PCECD版・PCFX版以降は未使用 |
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| 授業前のひととき | 授業方針選択 3DO版は教師データ登録でも使用 |
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| 出会いの春 | 4月～5月・3月のテーマ SS版・PS版・Win版はエンディング(進路)でも使用 |
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| 思い出の夏 | 6月～8月のテーマ SS版・PS版・Win版はエンディング(進路)でも使用 |
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| 哀愁の秋 | 9月～11月のテーマ SS版・PS版・Win版はエンディング(進路)でも使用 |
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| 別れの冬 | 12月～2月のテーマ PCECD版はアーケードカード読み込み中でも使用 |
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| 週末(職員室) | 仮曲名 PC98版の週末(職員室) PCECD版・PCFX版以降は別の曲を使用 |
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| ウィークエンド | 週末(校外) SS版・PS版・Win版はエンディング(進路)でも使用 |
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| 臨海教室 | 夏休み最終日の隠しグラフィック (*2) SS版・PS版・Win版はエンディング(進路)でも使用 PCFX版のサウンドテストでは「臨海学校」 |
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| 開会式 | 騎馬戦の騎手選択 PCECD版では未使用 PCFX版のサウンドテストでは「運動会開始」 |
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| 騎馬戦 (バトル) | 騎馬戦 PCECD版は内蔵音源版を騎手選択画面で使用 PCFX版のサウンドテストでは「騎馬戦」 |
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| 勝利！！ | 騎馬戦優勝、エンディングの教師評価 PCECD版・PCFX版では別のジングルを使用 |
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| 敗北・・・ | 騎馬戦敗退 PCECD版・PCFX版では別のジングルを使用 |
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| ロミオとジュリエット | 演劇のイントロ | ||
| 不思議の国のアリス | 演劇のイントロ | ||
| セーラーファイブ | 演劇のイントロ PCFX版のサウンドテストでは「美少女戦隊セーラーズ」 |
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| お化け屋敷 | お化け屋敷のイントロ | ||
| 演技中 | 演劇中・お化け屋敷中など | ||
| ずっこけ | 演劇・お化け屋敷の結果、エンディングの教師評価 PCECD版では別のジングルを使用 |
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| 不良行為発覚 | 仮曲名 喫煙・飲酒・アルバイトなどの発覚 「卒業II攻略法」のイントロ部分のフレーズを使用 SS版以降のものとは上記部分以外が異なる |
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| 試験中 | 試験中 | ||
| 全員退学 | ゲームオーバー PCFX版・SS版・PS版等は1人でも退学でゲームオーバー |
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| ファンファーレ | 試験結果、エンディングの教師評価 PCECD版・PCFX版では別のジングルを使用 |
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| 別れ | エンディング(進路) ※SS版・PS版・Win版は大学進学の場合のみで使用 3DO版はエンディング(卒業生答辞～別れの会話～進路) PCECD版・PCFX版では別の曲を使用 |
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| 受験日までは月月火水木金金 (インスト) | 仮曲名 石橋美佐子のテーマ PC98版・PCFX版の追跡調査での不良行為発覚 PCECD版の自己紹介・不良行為発覚・エンディング(進路) SS版以降は未使用 |
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| 校則、一代女 (インスト) | 仮曲名 犬塚さおりのテーマ PC98版・PCFX版の追跡調査での不良行為発覚 PCECD版の自己紹介・不良行為発覚・エンディング(進路) SS版以降は未使用 |
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| ミサンガが切れるまで (インスト) | 仮曲名 シンディ桜井のテーマ PC98版・PCFX版の追跡調査での不良行為発覚 PCECD版の自己紹介・不良行為発覚・エンディング(進路) SS版以降は未使用 |
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| OH! BOY (インスト) | 仮曲名 谷由利佳のテーマ PC98版・PCFX版の追跡調査での不良行為発覚 PCECD版の自己紹介・不良行為発覚・エンディング(進路) SS版以降は未使用 |
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| きっと、DEMO、本当に (インスト) | 仮曲名 安田舞奈のテーマ PC98版・PCFX版の追跡調査での不良行為発覚 PCECD版の自己紹介・不良行為発覚・エンディング(進路) SS版以降は未使用 |
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| 私立清華女子高等学校校歌「清華の乙女 」(インスト) | 仮曲名 PC98版のスタッフロール PCECD版・PCFX版以降はボーカル版を使用 |
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| PCエンジン版・PC-FX版 追加曲 | |||
| 卒業II攻略法 | 岩垂徳行 | OP主題歌 作詞：六月十三 歌：3年B組5人組 (*3) 前作の「卒業攻略法」の歌詞変更版 |
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| 職員室 | 週末(職員室) PCECD版・PS版・SS版・Win版は教師データ登録でも使用 |
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| 喫茶店 | 喫茶店のイントロ | ||
| ファンファーレA | 仮曲名 PCECD版のエンディングの教師評価 PCFX版の騎馬戦優勝 |
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| 騎馬戦敗退 | 仮曲名 | ||
| 全課程修了 | エンディング(別れの会話・最終パラメータ) 3DO版は卒業生代表選択 「卒業II攻略法」のフレーズを使用 |
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| 受験日までは月月火水木金金 | 岩垂徳行 | 石橋美佐子のイメージソング 作詞：溝口功 歌：南場千絵子 |
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| 校則、一代女 | 谷本真規 | 犬塚さおりのイメージソング 作詞：谷本真規 歌：萩森じゅん子 |
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| ミサンガが切れるまで | 大熊謙一 | シンディ桜井のイメージソング 作詞：溝口功 歌：浦和めぐみ |
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| OH! BOY | 溝口功 | 谷由利佳のイメージソング 作詞：溝口功 歌：鈴木砂織 |
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| きっと、DEMO、本当に | 大熊謙一 | 安田舞奈のイメージソング 作詞：溝口功 歌：中島千里 |
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| 私立清華女子高等学校校歌「清華の乙女」 | 作：谷本真規 編：岩垂徳行 |
スタッフロール 作詞：六月十三 歌：3年B組5人組 (*3) 前作と同じ曲 |
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| PCエンジン版 追加曲 | |||
| オチ | 仮曲名 演劇・お化け屋敷・喫茶店の結果、エンディングの教師評価 |
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| ファンファーレB | 仮曲名 試験結果・騎馬戦優勝、エンディングの教師評価 |
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| PC-FX版 追加曲 | |||
| 演劇祭・清華祭開幕 | 仮曲名 | ||
| クラスマッチ・体育祭開幕 | 仮曲名 | ||
| ミニゲーム開始 | 仮曲名 | ||
| ミニゲーム | 仮曲名 | ||
| ミニゲーム成功 | 仮曲名 | ||
| ミニゲーム失敗 | 仮曲名 | ||
| 夏祭り | 夏祭りイベント | ||
| クリスマス | クリスマスイベント | ||
| 初詣 | 初詣イベント PCFX版のサウンドテストでは「正月～初詣」 |
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| 告白 | 仮曲名 生徒からの告白イベント |
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| 卒業式開幕 | 仮曲名 「蛍の光」の冒頭4小節 |
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| 別れ | エンディング(進路) ※結婚以外 PC98版・SS版・PS版等のものとは別の曲 |
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| ウエディングマーチ | エンディング(進路) ※結婚 F.メンデルスゾーン「結婚行進曲」 |
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| セガサターン版・プレイステーション版 追加曲 | |||
| 不良行為発覚 | 喫煙・飲酒・アルバイトなどの発覚 SS版・PS版・Win版はエンディング(進路)でも使用 「卒業II攻略法」のイントロ部分のフレーズを使用 PC98版のものとは上記部分以外が異なる |
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| 3DO版 追加曲 (仮曲名) | |||
| 大ファンファーレ | 体育祭総合優勝、ミス清華コンテスト優勝 | ||
| 清華祭 | 清華祭での生徒との会話 | ||
| 留年 | スタッフロールの後のシーン | ||
| 卒業旅行 | スタッフロールの後のシーン コンサート大会でも使用 (*4) |
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