初音山駅。（ハツネヤマ）
隣の初音台同様、住宅街が広がる2面4線の駅である。駅から外回り方面に車庫があり、この駅を始発終点とする列車も運行されている（設定上）。2面4線なのはこのためである。 駅の北東に初音山があり、山の頂上には公園やテレビ塔が建っている。 この初音山から眺める初音市は絶景で、観光スポットとなっている。なお、初音山駅からはバスで初音山に行くことができる。
| 乗り場 | 路線 | 上下 | 行き先 | 備考 |
| 1番線 | 初音環状線 | 内 | 初音・黒岩方面 | |
| 2番線 | 初音環状線 | 内・外 | 各方面 | |
| 3番線 | 初音環状線 | 内・外 | 各方面 | |
| 4番線 | 初音環状線 | 外 | はつね緑野・栗戸方面 |
