| スキル名 | 効果 | ブースト装備 |
| リーダー | 船室キャラのスキル、１レベルにつき船員の最大士気+3%、僚艦艦長が斉射確率を高める | +1：パイプ、陶土パイプ、彫刻入り火縄銃、司南(雲睦)、船大工の鋸(静間芳隆)、三角帽(カトリーン)、イーグル戦士の鎧(マカ) |
| +2：ファラオの杖、ベルベットのコート、石に刺さった剣、月桂花冠、王者の剣、クラウ･ソラス、コンパス(アンドリュー)、隼の石刻(アブドゥラー)、皮の手袋(フィオナ)、レイピア(カルロス)、彫刻入り火縄銃(黒ひげ) | ||
| +3：聖人の杖、陶土パイプ(ヘンリー) | ||
| +5：クラウ･ソラス(グラディオ) | ||
| 操舵 | 船室キャラがスキルアップするごとに船の転向力+2%、破損数が下がる | +1：コンパス、騎士の長剣、王髄ネックレス |
| +2：七支剣 | ||
| +3： | ||
| +4以上： | ||
| マッピング | 船室キャラがスキルアップするごとに自動航行可能な文化圏距離+1 | +1：牽星板、砂時計 |
| +2： | ||
| +3：司南 | ||
| +4以上： | ||
| 火器 | 船室キャラがスキルアップするごとに大砲装填速度+3% | 眼帯[1] クリス[1] あかつき[1] 隼の石刻[1] 部族のネックレス[1] 三角帽(カトリーン)[1] 騎士団の剣[2] 越王勾践剣[2] 明光鎧[2] テーベのネックレス[2] 翡翠と金のサムリング[2] サイコロ(ナーセル)[2] あかつき(ディ－トリンデ)[2] 彫刻入り火縄銃(黒ひげ)[2] 黄金のペンダント[3] 張掖太守虎符[3] クラウ･ソラス(グラディオ)[3] |
| 修理 | 船室キャラがスキルアップするごとに船の最大老朽化-3% | +1：工芸道具箱、船大工の鋸、ローマのブレスレット |
| +2：七支剣 | ||
| +3：一剣三連(DLC) | ||
| +4以上： | ||
| 精算 | 船室キャラがスキルアップするごとに値上げ幅+2% | +1：天秤、シルクハット、サイコロ、そろばん |
| +2：厚雲、黄金の秤 | ||
| +3：ヘルメスの杖 | ||
| +4以上： | ||
| 料理の腕 | 船室キャラがスキルアップするごとに補給品の消費+3% | +1：フリジア帽子、エンゴベ処刑刀 |
| +2：赤サンゴの首輪、瓢箪（アンドレア装備時）、万丹の冠 | ||
| +3： | ||
| +4以上： | ||
| 演奏 | 船室キャラがスキルアップするごとに士気の消費度-10% | +1：チトラリ帽 |
| +2：箜篌、バイオリン | ||
| +3：セイレーンのハープ | ||
| +4以上： | ||
| 地理 | 地理の知識。本のキーワード解明に役立つ | +1：アンデスのニット帽、笠、高級望遠鏡、リングブローチ、コンパス（アンドリュー装備時） |
| +2：木彫りステッキ、九帰 | ||
| +3：九帰（陸礼淵装備時） | ||
| +4以上： | ||
| 生物 | 生物の知識。本のキーワード解明に役立つ | +1：アンデスのニット帽、瓢箪 |
| +2：花びらイヤリング | ||
| +3：雅楽の仮面 | ||
| +4以上： | ||
| 交渉 | 交渉の場で検定される | +1：三角帽、騎士団の剣、数珠丸、離樽 |
| +2：陶土パイプ | ||
| +3： | ||
| +4以上： | ||
| 帆の操縦 | 船室キャラがスキルアップするごとに船の速度+2% | 船員頭巾[1] 海賊シャムシール[1] アビシニアン鉤刀[1] 翡翠と金のサムリング[1] 騎士の長剣[1] 玉髄ネックレス[2] エトルリアのイヤリング[2] バイキングのアームレット[2] 一剣三連(DLC)[2] ゴルディアスの結び目[3] |
| 観察 | 船室キャラがスキルアップするごとに視界+5% | +1：赤サンゴの首輪 |
| +2：望遠鏡 | ||
| +3：高級望遠鏡 | ||
| +4以上： | ||
| 格闘 | 船室キャラがスキルアップするごとに船員不満値-3%、接舷速度が上昇 | +1：牛角の兜、雁翎刀、騎士の長剣、離樽、錆びだらけの長剣 |
| +2：ローマのブレスレット、剣闘士アーマー、童子切安綱、錆びだらけの長剣（アンドレアス・ハインリヒ装備時） | ||
| +3：銀鷹旗、離樽（沈士装備時） | ||
| +4以上： | ||
| 造船 | 造船Lv.3で船の改造機能が解放される。高いレベルだと改造内容も増える | +1：工芸道具箱 |
| +2：船大工の鋸 | ||
| +3：一剣三連(DLC) | ||
| +4以上： | ||
| 選別 | 品質が80%以上の商品は、+1レベルごとに毎日上級商品になる確率+3 | +1：シルクハット、帷帽、厚雲、数珠丸、月桂花冠 |
| +2：タロットカード、サイコロ | ||
| +3：タロットカード（エスメラルダ装備時） | ||
| +4以上： | ||
| 医術 | 船室キャラがスキルアップするごとに健康度消耗-3% | +1：ペスト医者のくちば |
| +2：ラシャコート、ペスト医師のくちばし（ダニエル・クレタ装備時） | ||
| +3：メス | ||
| +4以上： | ||
| 整理 | +1レベルごとに商品の品質-2% | +1：ガウン |
| +2：リングブローチ | ||
| +3： | ||
| +4以上： | ||
| 人文 | 人文の知識。本のキーワード解明に役立つ | +1：道袍、桃木の剣、花びらイヤリング、タロットカード、万丹の冠 |
| +2：仏牌 | ||
| +3： | ||
| +4以上： | ||
| 財宝 | 財宝の知識。本のキーワード解明に役立つ | +1：牛角の兜、彫刻入り火縄銃、精工ウズ鋼刀、九帰、黄金の秤、童子切安綱 |
| +2：九帰（陸礼淵装備時） | ||
| +3： | ||
| +4以上： |
