| 話数 | タイトル | 編成数 | 母艦 | GR | 難度 | 地形 | クリア報酬 | コンテナ | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DG細胞の恐怖 | Lv | 地・宇 | - | クリア不要 | |||||
| 邪竜族の残党 | Lv | 宇 | - | クリア不要 | |||||
| 6話-1 | マクロスフロンティア | Lv | 宇 | - | 連続ミッション | ||||
| 6話-2 | バジュラ母星 | Lv | 地・空 | 2 | 連続ミッション | ||||
| ISTO艦隊 | Lv | 宇 | - | ||||||
| ワープ航路分断作戦 | Lv | 宇 | - | ||||||
| 黒のオーガノイド | Lv | 地・空 | - | ||||||
| 共和国軍に物資を運べ | Lv | 地・空 | 3 | ||||||
| 7話-1 | マウントオッサ要塞 | Lv | 地・空 | - | 連続ミッション | ||||
| 7話-2 | シュバルツの攻勢 | Lv | 地・空 | 2 | 連続ミッション | ||||
| 7話-3 | 首都攻防 | Lv | 地・空 | - | 連続ミッション | ||||
| ゾイドイヴの捜索 | Lv | 地・空 | - | ||||||
| 黒の騎士団を名乗る女 | Lv | 地・空 | - | ||||||
| ドキドキスペース | Lv | 地・宇 | - | ||||||
| 8話-1 | アースティア | Lv | 地・空 | 2 | 連続ミッション | ||||
| 8話-2 | 邪竜海賊 | Lv | - | 連続ミッション | |||||
| ダ・サイダー再び | Lv | 地・空 | 2 | ||||||
| レアメタル採掘 | Lv | 地・空 | - | DLC | |||||
| レッドショルダー | Lv | 地・空 | - | ||||||
| サンサ攻略戦 | Lv | 地・空 | - | ||||||
| 9話-1 | サンサ戦介入 | Lv | 宇 | - | 連続ミッション | ||||
| 9話-2 | リーマンとの死闘 | Lv | 地・空 | - | 連続ミッション | ||||
| 9話-3 | ミューカスの種 | Lv | 地・空 | - | 連続ミッション | ||||
| ドラゴの影再び | Lv | 地・空 | - | クリア不要 | |||||
| グリフォンVSアルフォンス | Lv | 地・空 | - | クリア不要 | |||||
| 30バンチ事件 | Lv | 地・宇 | - | DLC |
