| 曲名 | 作曲・編曲者 | 補足 | 順位 |
| DISC1 | |||
| あの夏の隠れ家 | 水上浩介 | 歌：reche OP |
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| よし、出発! ～from ひと夏の大冒険～ | 大塚正子 | タイトル | |
| 空を未だ見ていたいから ～from ソラミミ～ | 柳川和樹 | ライザのテーマ | |
| 銀の音はるか ～from 銀の音さやか～ | クラウディアのテーマ | ||
| 方陰の大剣 ～from 願いと大剣～ | レントのテーマ | ||
| 挟んだままの栞 ～from 透明な栞～ | タオのテーマ | ||
| またまたよろしくね! | パーティーメンバー追加時 | ||
| 日差しが強くなる前に | チュートリアル | ||
| もう少しだけ読んでおこう | レシピ習得（参考書） | ||
| 一息ついて | 時間経過 | ||
| これを使って何しよう? | アイテム取得 | ||
| 新しい鍵を手に | システム解禁 | ||
| おうちじかん | 松村佑樹 | ||
| おでかけびより | |||
| 薫風けせらせら | 裏谷玲央 | ||
| おやすみクッション | 松村佑樹 | イベント | |
| 夏に還る景色 ～from 秘密の隠れ家～ | 柳川和樹 | アトリエ | |
| 煌めく空の下で | 大塚正子 | 採取地：カーク群島・昼 | |
| 夏の星空 | 採取地：カーク群島・夜 | ||
| 猫も杓子もかりものの | 松村佑樹 | 採取地：【街道、丘陵、田園系】昼 | |
| 猫も茶匙もかりものの | 採取地：【街道、丘陵、田園系】夜 | ||
| 藍色の大空 | 採取地：【廃村、山道】昼 | ||
| 銀の星を拾って | 採取地：【廃村、山道】夜 | ||
| 秋のクロッカス | 採取地：古びた大邸宅 | ||
| 夏暁 | 柳川和樹 | 通常戦闘（前半） | 第16回113位 第17回214位 第18回126位 2023年10位 通常戦闘曲74位 |
| Say that again! | 水上浩介 | 戦闘（強敵戦） | 2023年234位 |
| 盛暑の余韻 | 柳川和樹 | 戦闘勝利 | |
| DISC2 | |||
| 半分だけ昇った星 ～from ソラミミ～ | 柳川和樹 | ライザのテーマ2 | |
| 今は肩を並べて | ボオスのテーマ | ||
| 夢への一歩 ～from 自由への夢～ | パトリツィアのテーマ | ||
| 逆水のひとひら | フェデリーカのテーマ | ||
| 今日も肉がウマイ | ディアンのテーマ | ||
| 買い忘れを笑いあったら | ショップ | 2023年220位 | |
| ささらめく光のあしあと | 裏谷玲央 | ||
| 万緑と青空の下で | イベント | ||
| 予感 | 松村佑樹 | イベント | |
| どたどたんばたばたん | |||
| 夜の帳に包まれて | 大塚正子 | ||
| いと、わだかまる | 松村佑樹 | イベント | |
| 緊張の糸 | |||
| 猫の目 | 裏谷玲央 | イベント | |
| 魔石と硝子はこわれもの | 水上浩介 | サルドニカ・昼 他 | |
| カレットを星屑に | サルドニカ・夜 他 | ||
| 夏空に佇む丘 | 大塚正子 | 採取地：アストラード高地・昼 他 | |
| まばゆい光に照らされて | 採取地：アストラード高地・夜 他 | ||
| 大森林の息吹 | 水上浩介 | ネメド大森林・昼 他 | |
| 闇夜のそよめき | ネメド大森林・夜 他 | ||
| 小さなキララ | 松村佑樹 | 採取地：魔石搬送路・昼 他 | |
| 双子のキララ | 採取地：魔石搬送路・夜 他 | ||
| 乱反射リフレイン | 三武亜紗美 | 採取地：シンティラ鉱山 | 2023年443位 |
| やっつけちゃうぞ | 水上浩介 | 通常戦闘（後半） | 2023年314位 通常戦闘曲291位 |
| 揚げ雲雀群青 | 裏谷玲央 | シナリオボス戦 | 2023年60位 |
| DISC3 | |||
| 真実を掴んだら ～from この手でも掴める何か～ | 柳川和樹 | アンペルのテーマ | |
| 風豊か ～from 風静か～ | リラのテーマ | ||
| 風を観つづけて | カラのテーマ | ||
| 涙雲 | 大塚正子 | ||
| 深まる謎 | 松村佑樹 | イベント | |
| 時の波 | イベント | ||
| 胡蝶の夢 | 裏谷玲央 | イベント | |
| 降り注ぐ木漏れ日の中で | 大塚正子 | 採取地：ウルディスの聖跡・昼 他 | |
| 森の囁きに誘われて | 採取地：ウルディスの聖跡・夜 他 | ||
| 霧の残響 | 柳川和樹 | 採取地：鳥の峠・昼 | |
| 霧の残照 | 採取地：鳥の峠・夜 | ||
| 久遠の渡り鳥 | 三武亜紗美 | 採取地：廃神殿 | 第3回掘り出し293位 |
| 朽ちた記憶の音楽 | 松村佑樹 | 採取地：悠遠の匣 | |
| ひと夏の足跡 | 三武亜紗美 | ラストダンジョン | 2023年131位 |
| あの夏の隠れ家 – climax | 水上浩介 | ||
| The place to come back to one day. | ラスボス戦 | ||
| Epoché | 柳川和樹 | エルダートレント戦 | |
| Travelers | 加賀谷綾太郎 野津永恒 |
歌：suis from ヨルシカ ED |
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| DLC追加曲（ガスト30周年記念CD-BOX収録） | |||
| 雲砂に浮かぶ空 | 柳川和樹 | ||
| 雲砂に跳ねる星 | |||
| 翠巒の空音 | 採取地：アスラ・アム・バート辺境地域・昼 | ||
| 裾廻の清夜 | 採取地：アスラ・アム・バート辺境地域・夜 | ||
| DX版追加曲（ライザのアトリエ ～秘密トリロジー～ DX Recollection CD収録） | |||
| 未知の風に連れられて | 三武亜紗美 | 採取地：クレリア地方 | 2025年536位 |
| ささやく木陰 | |||
| Summer Storm | 増岡郷太 | DX版追加エピソード内戦闘BGM | |
| Letztes Sommerensemble：最後の夏のアンサンブル ～Atelier Ryza3 Special Arrange CD～収録 | |||
| 交叉点 | 柳川和樹 | 歌：近藤佑香 | |
| あの夏の隠れ家 (Chill Pop Ver. by 阿部隆大) | 水上浩介 編：阿部隆大 |
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| 夜の帳に包まれて (Bossa Nova Ver. by 樋口秀樹 Chorusl：葉月ゆら) | 大塚正子 編：樋口秀樹 |
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| おでかけびより (Motivative Pop Ver. by Dani) | 松村佑樹 編：Dani |
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| 猫も杓子もかりものの (Orchestra Ver. by 樋口秀樹) | 松村佑樹 編：樋口秀樹 |
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| ひと夏の足跡 (Industrial Rock Ver. by Dani) | 三武亜紗美 編：Dani |
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| やっつけちゃうぞ (Chip Tune Ver. by 阿部隆大) | 水上浩介 編：阿部隆大 |
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| 揚げ雲雀群青 (Asian Mixture Ver. by 中河 健) | 裏谷玲央 編：中河健 |
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| 今は肩を並べて (Vacation Ver. by 柳川和樹) | 柳川和樹 | ||
| 薫風けせらせら (Jazz Piano Ver. by 中河 健) | 裏谷玲央 編：中河健 |
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| 買い忘れを笑いあったら (After Closing Ver. by 柳川和樹) | 柳川和樹 | ||
| 猫も杓子もかりものの (Another Ver.) | 松村佑樹 | ||
| 猫も茶匙もかりものの (Another Ver.) | |||
| 久遠の渡り鳥 (Another Ver.) | 三武亜紗美 | ||
| 朽ちた記憶の音楽 (Another Ver.) | 松村佑樹 | ||
| 夜の帳に包まれて (Another Ver.) | 大塚正子 | ||
| Rectitude | 阿知波大輔 | 歌：悠花ユカ | |
| 『ライザのアトリエ３ ～終わりの錬金術士と秘密の鍵～』 パッケージ版購入特典 エクストラサウンドコレクション収録 | |||
| 故郷の稔るころ | 柳川和樹 | ||
| 虹の手をとり、隠れ家へ | 水上浩介 編：柳川和樹 |
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| 良き隣人として | 柳川和樹 | ||
