| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| Disc 1 | |||
| I AM...ALL OF ME / Opening ver. | 瀬上純 | オープニングテーマ 歌：Crush 40 |
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| SYSTEM: MAIN MENU | |||
| EVENT: PROLOGUE | 蓑部雄崇 | ||
| WESTOPOLIS | 瀬上純 | ステージ1 WESTOPOLIS（ウエストポリス） | |
| EVENT: INVADERS | 緊迫 | ||
| EVENT: VAST NAZCA | 広大なナスカ | ||
| GLYPHIC CANYON | ステージ2 GLYPHIC CANYON（グリフィックキャニオン） | ||
| EVENT: DOOM'S EYE | |||
| DIGITAL CIRCUIT | 作：瀬上純 編：杉山圭一 |
ステージ2 DIGITAL CIRCUIT（デジタルサーキット） | |
| LETHAL HIGHWAY | 瀬上純 | ステージ2 LETHAL HIGHWAY（リーサルハイウェイ） | |
| BOSS: BLACK BULL | VS.ブラックブル | ||
| EVENT: DETERMINATION | 大統領の決意 | ||
| EVENT: EG CENTRAL ROOM | エッグマン発見 | ||
| CRYPTIC CASTLE | ステージ3 CRYPTIC CASTLE（クリプティックキャッスル） | ||
| EVENT: SHUT YOUR MOUTH | エッグボス戦前 | ||
| BOSS: EGG BREAKER | VS.エッグブレーカー | ||
| EVENT: FLYING WITH TORNADO | |||
| CIRCUS PARK | 南波真理子 | ステージ3 CIRCUS PARK（サーカスパーク） | |
| PRISON ISLAND | 瀬上純 | ステージ3 PRISON ISLAND（プリズンアイランド） | |
| EVENT: NO WAY OUT | 蓑部雄崇 | 森に追いつめ、GUNの総攻撃 | |
| DEATH RUINS | 瀬上純 | ステージ4 DEATH RUINS（デスルーイン） | |
| SKY TROOPS | ステージ4 SKY TROOPS（スカイトループス） | ||
| EVENT: GREAT BLACK ARMS | 偉大なるブラックアームズ | ||
| CENTRAL CITY | ステージ4 CENTRAL CITY（セントラルシティ） | ||
| EVENT: PREPARATION FOR RITUAL | 儀式の前準備 | ||
| THE ARK | 瀬上純 大谷智哉 |
ステージ5 THE ARK（ジ・アーク） | |
| EVENT: SHADOW INCOMING | 瀬上純 | ||
| BOSS: BLUE FALCON | 作：瀬上純 編：Lee Brotherton |
VS.ブルーファルコン | |
| EVENT: ECLIPSE CANNON | 蓑部雄崇 | ||
| EVENT: BRIEF RELIEF | 瀬上純 | 安堵 | |
| EVENT: I KNOW PROFESSOR... | プロフェッサーの教え | ||
| GUN FORTRESS | ステージ6 GUN FORTRESS（GUNフォートレス） | ||
| EVENT: SHOWDOWN | 蓑部雄崇 | ブラックドゥーム戦前 | |
| BOSS: BLACK DOOM | VS.ブラックドゥーム | ||
| ENDING: EVIL ENDING | |||
| JINGLE: AWAKE HERO | 瀬上純 | ||
| JINGLE: AWAKE DARK | |||
| JINGLE: CHAOS CONTROL | |||
| JINGLE: CHAOS CONTROL SLOW ver. | |||
| JINGLE: ROUND CLEAR | |||
| SYSTEM: BATTLE MENU | |||
| 2P vs. BATTLE | |||
| DIGITAL CIRCUIT (Remix ver.) | 作：瀬上純 編：福原正博 |
ボーナストラック | |
| DIGITAL CIRCUIT (Original ver.) | 瀬上純 | ||
| CIRCUS PARK (Original ver.) | 南波真理子 | ||
| Disc 2 | |||
| SYSTEM: SELECT | 瀬上純 | ||
| SYSTEM: STORY | |||
| EVENT: TO THE WORLD OF THE MEMORY | 蓑部雄崇 | 記憶の世界へ | |
| LOST IMPACT | ステージ5 LOST IMPACT（ロストインパクト） | ||
| THE DOOM | ステージ4 THE DOOM（ザ・ドゥーム） | ||
| EVENT: FOOLISH HUMANS | 瀬上純 | 愚かな人間ども | |
| BOSS: HEAVY DOG | VS.ヘビードック | ||
| EVENT: ALL TORN DOWN | E510 | ||
| AIR FLEET | ステージ5 AIR FLEET（エアーフリート） | ||
| EVENT: TEAM CHAOTIX | |||
| EVENT: ELECTRIFIED | 電子の世界へ | ||
| MAD MATRIX | ステージ4 MAD MATRIX（マッドマトリックス） | ||
| EVENT: SHADOW ANDROID | |||
| IRON JUNGLE | ステージ5 IRON JUNGLE（アイアンジャングル） | ||
| LAVA SHELTER | ステージ6 LAVA SHELTER（ラバーシェルター） | ||
| EVENT: I REFUSE | EGGボス戦前 | ||
| BOSS: EGG DEALER | VS.エッグディーラー | ||
| ENDING: ANDROID ENDING | 蓑部雄崇 | ||
| EVENT: STRATEGY | 大谷智哉 | ||
| EVENT: RECOLLECTION OF THE ARK | 床井健一 | アークの回想 | |
| EVENT: WAY TO THE ARK | 瀬上純 | ||
| SPACE GADGET | ステージ5 SPACE GADGET（スペースガジェット） | 宇宙308位 | |
| COSMIC FALL | 作：瀬上純 編：杉山圭一 |
ステージ6 COSMIC FALL（コズミックフォール） | 宇宙165位 |
| EVENT: PERPLEXITY | 瀬上純 | 困惑のシャドウ | |
| EVENT: COMMANDER'S MEMORIES | 司令官の困惑 | ||
| EVENT: THE GRUDGE | 緊迫 | ||
| EVENT: IF WHAT YOU SAY IS TRUE... | もしそれが真実なら | ||
| ENDING: SAD ENDING | 蓑部雄崇 | ||
| EVENT: FEEL THE BLACK POWER | 瀬上純 | ||
| BLACK COMET | 作：瀬上純 編：大谷智哉 |
ステージ6 BLACK COMET（ブラックコメット） | |
| EVENT: SEA OF SORROW | 瀬上純 | マリアの回想 | |
| EVENT: FORTH INTO THE BLACK | 軍団のアジトへ | ||
| FINAL HAUNT | ステージ6 FINAL HAUNT（ファイナルホーント） | ||
| EVENT: BREAK YOU DOWN | 蓑部雄崇 | ソニック＆ディアブロン戦前 | |
| BOSS: DIABLON | 瀬上純 | VS.ソニック＆ディアブロン | |
| ENDING: HERO ENDING | 蓑部雄崇 | ||
| EVENT: DEFINITION OF INSANITY | 瀬上純 | CUE06 / PRS088B | |
| EVENT: THE WORLD CAME CRUMBLING DOWN | 蓑部雄崇 | E800C | |
| EVENT: MY PERFECT PLAN | 瀬上純 | E800D | |
| EVENT: PROFESSOR'S FAULT | プロフェッサーの過ち | ||
| EVENT: BETWEEN DARK AND DAWN | 蓑部雄崇 | 儀式の開始 | |
| THE LAST WAY | ファイナルステージ THE LAST WAY（ザ・ラストウェイ） | ||
| EVENT: HIDDEN MEMORIES | 驚愕 | ||
| EVENT: THE REAL TRUTH | 本当の真実 | ||
| EVENT: SUPER SHADOW | 瀬上純 | ||
| I AM...ALL OF ME / Final Doom ver. | VS.デビルドゥーム 歌：Crush 40 |
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| EVENT: THE MESSIAH | 蓑部雄崇 | 最後の大仕事 | |
| EVENT: FINALE | 大団円 | ||
| EVENT: I AM...THE STORY IS OVER | 瀬上純 | クロージング | |
| LOST AND FOUND:SHADOW THE HEDGEHOG VOCAL TRAX | |||
| I Am...All of Me | 瀬上純 | メインテーマ 歌：Crush 40 |
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| Almost Dead | POWERMAN 5000 | イビルエンディングテーマ 歌：POWERMAN 500 |
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| Waking Up | Amir Derakh | アンドロイドエンディングテーマ 歌：Julien-K |
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| E.G.G.M.A.N. Doc. Robeatnix Mix | Dr.エッグマンのテーマソング 歌：Remix Factory |
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| The Chosen One | A2 | サッドエンディングテーマ 歌：A2 |
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| All Hail Shadow | MAGNA-FI | ヒーローエンディングテーマ 歌：MAGNA-FI |
第3回掘り出し2位 |
| Never Turn Back | 瀬上純 | ファイナルエンディングテーマ 歌：Crush 40 |
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