生物 - clade @ ウィキ

一般的な系統

細胞生物 / 細胞性生物 (Cyota)

1. 細菌 / バクテリア (Bacteria) = 真正細菌 (Eubacteria)
2. ネオムラ / ネオミューラ (Neomura) = 広義のアーキア (Archaea sensu lato)
   1. 古細菌 (Archaebacteria) = アーキア / アーケア / アルケア / 始原菌 (Archaea) = 後生細菌 (Metabacteria)
   2. 真核生物 (Eukaryote) = ユーカリア (Eukarya)

生物は、細菌、古細菌、真核生物の3グループからなります。
これらのうちでは、古細菌と真核生物とが姉妹群です。

英語では、分類群の名前としては、Bacteria, Archaea, Eukaryaを使います。ただし、prokaryote(原核生物)の対義語としては、Eukaryoteを使います。

エオサイト説

細胞生物 / 細胞性生物 (Cyota)

1. 細菌 / バクテリア (Bacteria) = 真正細菌 (Eubacteria)
2. ネオムラ / ネオミューラ (Neomura) = 広義のアーキア (Archaea sensu lato)
   1. ユーリアーキオータ / ユーリ古細菌 (Euryarchaeota)
   2. N.N.
      1. クレンアーキオータ / クレン古細菌 (Crenarchaeota) = エオサイト (Eocyte)
   3. 真核生物 (Eukaryote) = ユーカリア (Eukarya)

古細菌は単系統ではなく、真核生物は古細菌の内系統になります。
このばあい、アーキアという名称を廃止せずに、真核生物を含むものに拡張することがあります。

古細菌のうち、真核生物の姉妹群をエオサイトと呼びます。
具体的には、クレンアーキオータがエオサイトと思われます。
(なお、エオサイトは、「最初の生命」という意味で使われることもあります)

生命誌研究館≫生物最古の枝分かれ：問題点と重複遺伝子による解決

ネオムラ説

細胞生物 / 細胞性生物 (Cyota)

1. 緑色硫黄細菌 (Chlorobacteria)
2. N.N.
   1. ハドバクテリア / 波動細菌 (Hadobacteria)
   2. N.N.
      1. シアノバクテリア / 藍色細菌 / 藍菌 (Cyanobacteria) / 藍藻 (Cyanophyta)
      2. N.N.
         1. グラシリクテス / グラシリキューテス (Gracilicutes)
            1. スピロヘータ類 / スピロケータ類 (Spirochaetae = Spirochaetes)
            2. N.N.
               1. スフィンゴバクテリア (Sphingobacteria)
               2. 外鞭毛類 (Exoflagellata)
                  1. プランクトバクテリア (Planctobacteria)
                  2. プロテオバクテリア (Proteobacteria) ⊃ミトコンドリア
         2. ユーリバクテリア / 広細菌 (Eurybacteria) + 単膜類
            1. セレノバクテリア (Selenobacteria)
            2. フソバクテリア (Fusobacteria)
            3. トゴバクテリア (Togobacteria)
            4. 単膜類 (Unimenbrana) = グラム陽性菌 + 真核生物 = ユニバクテリア + ネオムラ
               1. エンドバクテリア / 内細菌 (Endobacteria)
               2. アクチノバクテリア / 放線菌門 / 放線菌綱 / 放線菌関連細菌 (Actinobacteria) + ネオムラ
                  1. コリオバクター亜綱 (Coriobacteridae) = コリオバクター目 (Coriobacteriales)
                  2. ルブロバクター亜綱 (Rubrobacteridae)
                  3. アシドミクロビウム亜綱 (Acidimicrobidae) = アシドミクロビウム目 (Acidimicrobiales)
                  4. ビフィドバクテリウム目 (Bifidobacteriales)
                  5. プロテアテス (Proteates)
                     1. 放線菌 (Actinomycetales)
                     2. ネオムラ / ネオミューラ (Neomura) = 広義のアーキア (Archaea sensu lato)
                        1. 古細菌 (Archaebacteria) = アーキア / アーケア / アルケア / 始原菌 (Archaea) = 後生細菌 (Metabacteria)
                        2. 真核生物 (Eukaryote) = ユーカリア (Eukarya)

真正細菌が側系統とする説です。

• Cavalier-Smith 2006. Rooting the tree of life by transition analyses.