ショップはシナリオ進行やボスを倒すと入手できます。 セーブポイントからショップに入れます。 シナリオ進行によりショップの品揃えが増加します。
シナリオ進行(自動入手)
| 名称 | 章 | 入手タイミング |
| ユニコーンマート | 1 | 初期 |
| B&W野外用品店 | 2 | 初期イベント |
| アップインアームス | 3 | 落：戦闘爆撃機カルラ（ビルジ湖：放棄都市の門） |
| LENORAガレージ | 4 | 落：ドレッドノート（ヴァイルピークス：解体作業場跡） |
| マジカルモーメント | 5 | 落：ヘビーモス（ガプラ樹林：試験場Dフィールド） |
| 生体素材けものや | 5 | 落：試作機ユイジンシャン（ガプラ樹林：兵器整備棟） |
| プラウトス武具工房 | 7 | 落：飛空戦車グライフ（商業都市パルムポルム：エストハイム邸） |
| 鉱脈堂本舗 | 8 | 落：突撃砲レーヴェ（ノーチラス・パーク：時計塔） |
| モーグリワークス | 10 | 落：シド・レインズ |
| 聖府軍技術実験局 | 12 | 落：守護騎アナヴァタフタ |
| エデン薬化学センター | 12 | 落：ブラウド・クラッド |
ミッション等で入手
| 名称 | 章 | 入手タイミング |
| 特殊マテリアル研究所 | 11 | 落：ビトゥイトス（ミッション07にて出現） |
| ギルガメッシュ機関 | 11 | 落：ジルニトラ（ミッション46にて出現、ファルシタイタンミッションクリア） |
