| 設置 | 設置内閣 | 廃止 | 備考 | ||
| 法務庁 | 特命担当大臣(法務) | 1981.6 | 片山内閣(改造) | ||
| 警察庁 | 特命担当大臣(公安) | ||||
| 公衆衛生庁 | 特命担当大臣(公衆衛生) | ||||
| 電気通信庁 | 特命担当大臣(電気通信) | 1989.10 | |||
| 経済企画庁 | 特命担当大臣(経済財政) | 1987.5 | 内原内閣 | 2009.5 | |
| エネルギー庁 | 特命担当大臣(エネルギー) | 1989.10 | 瀬川内閣 | 1998.12 | |
| 防災庁 | 特命担当大臣(防災) | 1996.8 | 第3次船中内閣(第3次改造) | 2007.7 | |
| 消費者庁 | 特命担当大臣(消費者) | 1998.12 | 室堂内閣(第1次改造) | 2009.5 | |
| 原子力庁 | 特命担当大臣(原子力) | 2009.10 | 第1次日吉内閣(第1次改造) | ||
| 情報庁 | 特命担当大臣(情報) | 2021.8 | 島内閣 |
| 設置 | 設置内閣 | 廃止 | 備考 | ||
| 地方創生戦略本部 | 特命担当大臣(地方創生) | 1981.6 | 片山内閣(改造) | 1997.8 | |
| 民力活性推進本部 | 特命担当大臣(民力活性) | 1997.8 | |||
| 1億総活躍推進本部 | 特命担当大臣(1億総活躍) | ||||
| 大気海洋汚染対策・環境保全総合本部 | 特命担当大臣(大気海洋汚染対策・環境保全) | 1983.6 | 浅上内閣 | 1984.6 | |
| 環境保全総合本部 | 特命担当大臣(環境) | 1984.6 | 浅上内閣(改造) | 1997.8 | |
| 教育再生実行会議 | 特命担当大臣(教育再生) | 1987.5 | 内原内閣 | 1997.8 | |
| 人権政策推進本部 | 特命担当大臣(人権政策) | 1989.10 | 瀬川内閣 | 1997.8 | |
| 領土問題対策本部 | 特命担当大臣(領土問題) | ||||
| 女性活躍推進本部 | 特命担当大臣(女性活躍) | ||||
| 総合的人権問題対策本部 | 特命担当大臣(人権) | 1997.8 | 室堂内閣 | 2009.5 | |
| 国土緑化戦略推進本部 | 特命担当大臣(国土緑化) | 2009.5 | |||
| 地域未来戦略本部 | 特命担当大臣(地域未来戦略) | 2009.5 | |||
| 国家戦略特区推進本部 | 特命担当大臣(国家戦略特区) | 2009.5 | |||
| 国土強靭化・総合開発推進本部 | 特命担当大臣(国土強靭化・総合開発) | 2009.5 | |||
| 公務員制度改革本部 | 特命担当大臣(公務員制度改革) | 2000.8 | 第1次山口内閣 | 2009.5 | |
| 原子力開発推進本部 | 特命担当大臣(原子力開発) | 2007.7 | 山川内閣(第1次改造) | 2009.5 | |
| 情報庁設置準備室 | 特命担当大臣(情報庁設置準備) | 2009.5 | |||
| 国家情報運用戦略本部 | 特命担当大臣(国家情報運用戦略) | 2009.5 | |||
| 総合安全保障戦略本部 | 特命担当大臣(総合安全保障) | 2008.7 | 山川内閣(第2次改造) | 2009.5 | |
| 国際協力機構設立準備室 | 特命担当大臣(国際協力機構) | 2009.5 | |||
| 男女共同参画社会推進本部 | 特命担当大臣(男女共同参画社会推進) | 2009.5 |
| 設置 | 設置内閣 | 廃止 | 備考 | ||
| 1億総活躍推進本部 | 特命担当大臣(1億総活躍) | 1981.6 | 片山内閣(改造) | 承継 | |
| 領土問題対策本部 | 特命担当大臣(領土問題) | 1989.10 | 瀬川内閣 | 承継 | |
| 女性活躍推進本部 | 特命担当大臣(女性活躍) | 1989.10 | 瀬川内閣 | 承継 | |
| 公共投資実行推進本部 | 特命担当大臣(公共投資) | 2009.5 | 第1次日吉内閣 | 2015.8 | |
| 命の現場再生実行本部 | 特命担当大臣(命の現場) | 2014.3 | |||
| 市民社会共生推進本部 | 特命担当大臣(市民社会) | 2014.3 | |||
| 地方創生戦略本部 | 特命担当大臣(地方創生) | 復活 | |||
| 産業競争力総合本部 | 特命担当大臣(産業競争力) | 2014.3 | |||
| 農村里山戦略本部 | 特命担当大臣(農村里山戦略) | 2009.10 | 第1次日吉内閣(第1次改造) | 2015.8 | |
| 東海大震災復興本部 | 特命担当大臣(復興) | 2013.5 | 第2次篠原内閣 | ||
| 科学技術振興推進本部 | 特命担当大臣(科学技術) | 2014.3 | 第2次日吉内閣 | 2015.8 | |
| 対外経済政策総合本部 | 特命担当大臣(対外経済) | 2015.8 | |||
| 少子化対策推進本部 | 特命担当大臣(少子化対策) | 2015.8 | |||
| 行財政機構改革本部 | 特命担当大臣(行財政改革) | ||||
| 男女共同参画推進本部 | 特命担当大臣(男女共同参画) |
| 設置 | 設置内閣 | 廃止 | 備考 | ||
| 1億総活躍推進本部 | 特命担当大臣(1億総活躍) | 1981.6 | 片山内閣(改造) | 承継 | |
| 領土問題対策本部 | 特命担当大臣(領土問題) | 1989.10 | 瀬川内閣 | 承継 | |
| 女性活躍推進本部 | 特命担当大臣(女性活躍) | 1989.10 | 瀬川内閣 | 承継 | |
| 地方創生戦略本部 | 特命担当大臣(地方創生) | 2009.5 | 第1次日吉内閣 | 承継 | |
| 東海大震災復興本部 → 復興推進本部 | 特命担当大臣(復興) | 2013.5 | 第2次篠原内閣 | 承継、2019.7に改組 | |
| 行財政機構改革本部 | 特命担当大臣(行財政改革) | 2014.3 | 第2次日吉内閣 | 承継 | |
| 男女共同参画推進本部 | 特命担当大臣(男女共同参画) | 2014.3 | 第2次日吉内閣 | 承継 | |
| 地方分権拡充推進本部 | 特命担当大臣(地方分権拡充推進本部) | 2015.8 | 深沢内閣 | ||
| 情報庁設置準備室 | 特命担当大臣(情報庁設置準備) | 2021.8 | 島内閣 | 2022.1 | 復活 |
