設立当初はニコ鉄とは無関係だったが、鉄道輸送へのモーダルシフトを行うために、小神支社と業務提携し関連会社となった。 従来型の貨物列車を利用する他、新型貨物であるM250系を保有し、都市間の高速輸送にも対応しており、志村貨物ターミナルといった貨物ターミナル駅を拠点に事業所を展開している。 現在の社長である金糸雀氏は『全国に店舗を拡大するのかしら』と常々公言しているが、当初は小神支社外への進出予定はなかった。最近は同氏の手腕のおかげか徐々に店舗網拡大中。 なお、宅配便としては、『カナリア便』『スーパーカナリア便』の名前でサービスを提供している。
ただいまニコニコ通運では事業所を置いてくださる支社・会社様を募集しています。 花南には許可を求めなくてもいいのでどしどし作ってくださると嬉しいです。 あと花南と金糸雀（小神ver）の画像をまとめたzipを、このページの添付に置いておきますので紙芝居に使いたい方がいらしたらどうぞおもちください。
