合体を行うためには、いくつかの細かいルールがあります。
まず、召喚スペルカードが2枚以上必要です。（召喚スペルカードの最大所持数は12枚です）次に、ベルベットルーム内のペルソナのストックに空きが必要です。（ストックの最大は16体です）
1 悪魔と接触したときにコンタクトを行い、悪魔から召喚スペルカードをもらいます。
2 ベルベットルームにて主人イゴールに合体を依頼します。
3 どの召喚スペルカードを使うか、合体組み合わせ表から2体選んで決定すると、画面下部に合体結果が表示されます。（方向キーの上下左右で、赤いバーの交差する箇所を指定して、◯ボタンで決定）
4 イゴールが指定された悪魔の召喚を行い、それらを合体させて新たなペルソナを作り出します。
注意
このとき、作ってほしいペルソナのレベルが主人公のレベルよりも10以上高いときは、イゴールは合体を行ってくれません。（あまり高位のペルソナを見せるのは主人公たちに危険なため）また、既に持っているペルソナを合体でつくることはできません。
5 新たなペルソナは、イゴールがベルベットルーム内に16体までストックしてくれますので、必要な場合は、今度はイゴールに降魔を依頼します。
6 ストックされているペルソナの一覧表が表示されますので、そこで誰にペルソナを降魔させたいのかを選択し、次にどのペルソナを降魔してほしいかを決定します。
注意
この時、降魔させたいキャラクターの降魔レベル（P-LEVEL）がペルソナのレベルより低いときは、ペルソナに精神を支配される可能性があるため、イゴールは降魔をしてくれません。
7 ペルソナはキャラクター1人につき3体まで降魔させることが可能で、そのうちの1体をアクティブ状態（→
ペルソナについて参照）にすることによって…
※キャラクターがペルソナを複数降魔している場合、アクティブ状態のペルソナに対して、残りのペルソナの状態はチャージ状態（→
ペルソナについて参照）といいます。
8 戦闘中に常にそのペルソナを発動（→
ペルソナについて参照）することができます。また、発動するにはSPの消費を必要とします。（SPの消費量はペルソナ毎に違いますが、1体のペルソナが複数の攻撃方法を持っていた場合、どの攻撃方法を行っても1回に消費するSP値は同じです）
1 ベルベットルームにて主人イゴールに合体を依頼すると、「セルフ合体」と「ガイド合体」のどちらで合体を行うのかたずねてきますので、「ガイド」を選んでみましょう。
2 すると、検索結果一覧表が表示されます。今持っている召喚スペルカードを使って作ることのできるペルソナが一通り紹介されますので、その中から作りたいペルソナを決定します。
3 このとき指定のペルソナを作るための悪魔の組み合わせが複数あるときは、このあとに組み合わせの一覧が表示されます。そこでどの召喚スペルカードを使った組み合わせにするかを決めてください。気にいらないときは╳ボタンを押せばやり直せます。
4 全て良ければ◯ボタンを押してください。するとこれからイゴールが合体してくれるベルソナの詳しいステータス画面が表示されます。
5 ここでイゴールが「これでよいですかな？」とたずねてきますので、良ければ「はい」を選択してください。これで合体が始まります。あとはイゴールが全てやってくれます。合体が終わったらイゴールに降魔を頼んでみましょう。
パーティがアイテムを所持している場合、合体をしている途中で、イゴールに「アイテムを加えるか？」とたずねられます。このときに何かいらないアイテムがあったら選んで加えてみましょう。
アイテムを加えることによって、合体後にいろいろな効果が現れます。この効果はアイテムの種類によってさまざまな違いがでてきますので、いろいろと試しながらアイテムと効果の関係を見つけてみましょう。
ペルソナは最大で、チャージ状態の15体と、ストック状態の16体の合計31体までしか持てません。いっぱいになった状態で新たなペルソナを作りたいときは、ベルベットルーム内に入ったときのメニューの中から「降魔／消去」を選択して、次に表示される画面で「DELETE」を選んだ後、消去したいペルソナを決定します。
ペルソナのランクは、一度消すと再び合体して作り直したときには一番低いランクの1に戻ってしまいますので、育てて強くなったペルソナを消すには注意が必要です。また、このときランクが8に達しているペルソナのみ、アイテムと交換してもらうことができます。交換してもらえるアイテムは消すペルソナによってそれぞれ違います。
| 記号 |
◯
⭢
✕ |
（マル） 通常の合体が行われます
（矢印） 魔法が継承されることがあります。
（バツ） 合体できません。 |
| 矢印の向き |
⭡
⭢
⭣ |
（上向き） 同じ大種族の組み合わせです。
（横向き） 相性の良い種族の組み合わせです。
（下向き） 相性の悪い種族の組み合わせです。 |
| 色 |
青
白
赤 |
（青文字） 同じ大属性の組み合わせです。
（白文字） 属性の影響のない組み合わせです。
（赤文字） 反対の大属性の組み合わせです。（事故が起きやすい） |
【出典】
株式会社アトラス．「合体について」．『女神異聞録ペルソナ 解説書』．株式会社アトラス．1996，p.78-81
