- 荒廃都市ウェイロンの左右分岐で一度選ぶとクリア後も選ばなかった道には行けない。（進行上はどちらでも問題ない）
左ルートを推奨？（遠回り側）
- ヲロ駅の盗掘クエストを手伝うと一部エリアが出現しなくなる。（進行には問題ない）
- 発火させるとVITキルできなくなる（9/6時点）
- 梵天夜市のチェンシーが教えてくれるクエストは「色欲・影」の討伐だが実際は「デッドヘレティック・影」がでる。
ハートル集めに。（約3％のドロップ率）
- 死皇帝ヴォーパレストを討伐したときまれに浄化数（スモッグ辞典）が増えないことがある？
- ボトル回収してもまれに消えない湧き水がでることがある？（9/6時点）
- EP13開始 X383についたあと駅から電車にのると戻れないかも？（NPCにはなしかけ五色街行きにのる）
（EPの都合上通常の電車にのることができない）
アウドーラ要塞のルーレットボーナスの「封・闘志宿醒」を使用すると結晶体「闘気宿醒」がてにはいるが、この結晶は全く効果がないのでルーレットで入手してしまった場合は結晶の触媒に使おう。
※Ver1.5.5でこのバグは修正された。
- アウドーラ要塞のボスは巨大型というヒント以外はない。戦闘開始すると姿が見えない機械型となる。
- 一度開くと「ジャンクショップ」（左上）という文字が消えないお店がある。
別のジャンクショップを開いて閉じると消えることもある。
- 丑三つ時エフェクトを表示したままエリア移動（他の街などに移動）すると一部エフェクトが消えないまま進行することになる。
再度丑三つ時エフェクトを表示させ、4時以降にして消すことができる。
- 沈没船専用？のザコ敵がバグってる。（表示されない、ゲージだけだったり等、最初からHPがない）
- 幽幽万人杭奥地のマップ接続がおかしい（ディ・ガイアが出るエリアから移動すると直前のエリアでない場所に出る）
- フォースドライブを装備したキャラが１度戦闘不能になるとその戦闘中は保証ダメージの効果がなくなる。
- ライアラック修道院跡地のクエストボスの魔障霧×５を倒せた人います？
