事務所でレイの話を聞き、雲雀ヶ丘へ。
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天堂屋敷の門前でタカシと遭遇、屋敷に侵入。ボス戦あり。
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各地下水道の、雲雀ヶ丘地下水道に続く扉のロックが解除される。
（この時点では雲雀ヶ丘フィールド上からは雲雀ヶ丘の地下水道に入れない）
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探偵事務所で久美子の両親から依頼を受ける（選択）。
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中央区、新市庁舎へ。
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60Fで藤原市長に会う。60Fの市議会議事堂の道が開く。
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40Fでボス戦。
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シドを追って擬似アストラル界へ。
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出入り口付近で葛葉の魂と合流、久美子のところへ。ボス戦あり。
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無間地獄へ落とされる。
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カロンの元へ。
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現世に戻り、レイと合流。
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フィールド上から雲雀ヶ丘の地下水道に入れるようになる。造魔戦あり。
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矢来区のコインロッカーで教授のメモを入手。
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異界化した中央公園へ。
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シドの要求を聞き、雲雀ヶ丘地下水道へ。石室のレバーを引く。
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再び中央公園へ。妖樹林を通り、古墳へ。
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古墳B6Fでボス戦×2。
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古墳B8F、ボスの部屋一歩手前にたどりつけば、隠しダンジョンのフラグON。
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シドとの決戦後、ラストバトルへ（シド戦を含め三連戦）。
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エンディングへ。
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矢来区地下水道B2Fから異界へ。ボス戦あり。
