| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| Disc1 | |||
| メインテーマ | 下村陽子 成田勤 |
タイトル画面 | 第4回521位 第5回89位 第6回223位 第7回130位 第8回402位 第9回257位 第10回202位 第11回524位 第12回964位 第13回139位 2010年39位 第2回任天堂87位 オープニング14位 癒し64位 ピアノ65位 歴代218位 |
| プロローグA | OP前半(戦闘まで) | ||
| プロローグB | OP後半(戦闘後から)など | ||
| 日常 | 清田愛未 | ||
| 思い出 | |||
| 親しき人への想い | |||
| モナド発動 | ACE+ | ||
| 危機 | コロニー9襲撃時など | ||
| 敵との対峙 | イベントムービー時 | 第4回3位 第5回5位 第6回103位 第7回53位 第8回263位 第9回54位 第10回54位 第11回55位 第12回62位 第13回24位 2010年31位 2020年47位(DE) 任天堂30位 第2回任天堂30位 RPGバトル119位 歴代66位 泣き曲138位 | |
| 悲しみ | 清田愛未 | ||
| 神秘 | |||
| 回想 | |||
| 焦り | ACE+ | ||
| 陰謀 | 清田愛未 | ||
| 悔恨 | |||
| 顔つき | 巨神脚でのゾード登場シーンやヴァラク雪山でのムムカ登場シーンなど | ||
| 不安 | |||
| 引けない戦い | 下村陽子 成田勤 |
コロニー6でのダンバン加入時のイベントシーン | 第5回85位 第6回361位 第7回912位 第8回738位 第9回551位 2010年75位 RPGバトル131位 |
| 予感 | 清田愛未 | ||
| 回想 / オルゴール | |||
| 伝説の勇者リキ | ACE+ | ヴァンダム登場シーンやリキ登場シーン | |
| Disc2 | |||
| エギル | 清田愛未 | ||
| 巨大な影 | |||
| 悲壮な決意 | ACE+ | 帝都アグニラータでのヤルダバオト戦や逆上のバーン戦など | |
| シュルクとフィオルン | 下村陽子 ACE+ |
シュルクとフィオルンの会話シーンなど メインテーマのアレンジ |
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| リキの優しさ | ACE+ | 落ちた腕でのリキとダンバンの会話シーン | |
| 希望 | 清田愛未 | ゼノブレイドDE：『つながる未来』のナカマトーク「光と影の絆」 (ゼノブレイドDE以外では未使用曲) |
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| 忍び寄る影 | |||
| 緊張 | |||
| 決戦前夜 | ACE+ | 巨神界連合軍が大剣の渓谷に攻め込むシーンなど | |
| 想いは内に… | 巨神胎内でのメリアとカリアンの会話シーンなど | 第5回576位 ピアノ213位 泣き曲109位 | |
| 怒り、心の闇 | 清田愛未 | ||
| 巨神の目覚め | 巨神が動き出すシーン | ||
| 精神世界 | |||
| ザンザ | ラスボス戦第一･第二段階目戦闘曲 | 第5回382位 2020年372位(DE) ラストバトル287位 | |
| 神を絶ちし剣 | ACE+ | ラスボス戦第三段階目戦闘曲 | ラストバトル233位 |
| 雄大 | テフラ洞窟を抜けた直後のシーンなど | ||
| 別れ、そして… | コロニー9出発時や帝都アグニラータ脱出時のシーンなど | 泣き曲140位 | |
| それぞれの未来へ | 清田愛未 | ||
| Beyond the Sky | 光田康典 | エンディング曲 作詞：高橋哲哉・歌：Sarah Àlainn |
第5回348位 第6回931位 第7回595位 第9回523位 第10回873位 第11回863位 2010年55位 第2回ゲームソング136位 第3回ゲームソング38位 エンディング27位 癒し167位 泣き曲152位 |
| エピローグ | 下村陽子 成田勤 |
スタッフロール曲 | |
| Disc3 | |||
| 故郷 | 下村陽子 | コロニー9（モンスター非活動地域） | |
| 故郷 / 夜 | 下村陽子 ACE+ |
コロニー9（モンスター非活動地域）夜 | |
| コロニー9 | 下村陽子 | コロニー9（モンスター活動地域） | フィールド257位 |
| コロニー9 / 夜 | 下村陽子 ACE+ |
コロニー9（モンスター活動地域） 夜 | 夜140位 |
| 戦闘！ | 下村陽子 | 巨神界通常戦闘曲 | |
| テフラ洞窟 | 清田愛未 | テフラ洞窟 | |
| ガウル平原 | ACE+ | 巨神脚、コロニー6（コロニー外） 昼 | 第4回44位 第5回12位 第6回28位 第7回24位 第8回56位 第9回41位 第10回69位 第11回58位 第12回96位 第13回87位 2010年21位 2020年155位(DE) 任天堂51位 第2回任天堂24位 フィールド6位 歴代37位 |
| ガウル平原 / 夜 | 巨神脚、コロニー6（コロニー外） 夜 | 夜143位 | |
| 脱出艇キャンプ | 清田愛未 | 巨神脚(脱出艇キャンプ) | 第10回807位 町曲179位 癒し161位 ピアノ148位 |
| コロニー6 ～中央採掘場～ | 中央採掘場 | ||
| 行く手を阻む者 | ACE+ | ボス戦BGM | 第4回274位 第5回721位 第6回664位 第7回810位 第8回997位 第9回723位 第10回729位 第11回826位 第12回531位 第13回528位 任天堂77位 2010年159位 |
| 燐光の地ザトール | 清田愛未 | 燐光の地ザトール | |
| 燐光の地ザトール / 夜 | 燐光の地ザトール 夜 | 第4回454位 第5回198位 第6回326位 第7回412位 第8回580位 第9回368位 第10回754位 第12回330位 第13回721位 2010年85位 フィールド54位 癒し144位 夜5位 | |
| 纏わり付く視線 | ACE+ | 巨神界通常戦闘曲その２ （エネミーに感知されたor「おびきよせ」使用時） |
|
| コロニー6 ～静寂～ | 清田愛未 ACE+ |
コロニー6(復興度0%～24%) | |
| マクナ原生林 | 清田愛未 | マクナ原生林 | フィールド193位 癒し58位 |
| マクナ原生林 / 夜 | マクナ原生林 夜 | ||
| サイハテ村 | サイハテ村 | 町曲165位 癒し48位 | |
| サイハテ村 / 夜 | サイハテ村 夜 | 夜104位 | |
| エルト海 | エルト海 | ||
| エルト海 / 夜 | エルト海 夜 | ||
| 皇都アカモート | 皇都アカモート | ||
| 皇都アカモート / 夜 | 清田愛未 ACE+ |
皇都アカモート 夜 | |
| 祖霊の眠る地 | 清田愛未 | ハイエンター墓所 | |
| コロニー6 ～再興～ | コロニー6(復興度25%～49%) | ||
| Disc4 | |||
| 監獄島 | 清田愛未 | 監獄島(1回目) | |
| 敵の猛追 | ACE+ | 戦闘 劣勢時 | |
| 未来視発動 | 未来視タグ破壊時 | ||
| ヴァラク雪山 | ヴァラク雪山 | ||
| ヴァラク雪山 / 夜 | ヴァラク雪山 夜 | 冬・雪・氷45位 | |
| 大剣の渓谷 | 清田愛未 | 大剣の渓谷 | |
| 大剣の渓谷 / 夜 | 大剣の渓谷 夜 | ||
| ガラハド要塞 | ガラハド要塞 | ||
| 名を冠する者たち | ACE+ | ユニークモンスター戦闘曲 一部ボス戦闘曲 |
第4回5位 第5回1位 第6回3位 第7回6位 第8回7位 第9回2位 第10回15位 第11回12位 第12回10位 第13回3位 2010年2位 2020年227位(DE) 任天堂16位 第2回任天堂3位 RPGバトル1位 歴代9位 |
| 堕ちた地で… | 清田愛未 | 落ちた腕 | |
| 堕ちた地で… / 夜 | 落ちた腕 夜 | 夜180位 | |
| コロニー6 ～希望～ | 清田愛未 ACE+ |
コロニー6(復興度50%～74%) | |
| マシーナの隠れ里 | 清田愛未 | 落ちた腕(マシーナの隠れ里) | |
| 機神界フィールド | ACE+ | 機神界フィールド | 第4回283位 第5回315位 第6回526位 第7回268位 第8回364位 第9回486位 第10回627位 第11回283位 第12回432位 第13回282位 2010年109位 第2回任天堂134位 フィールド72位 ダンジョン33位 |
| 機の律動 | 機神界通常戦闘曲（「大剣の渓谷」のみ「戦闘！」） | 第4回7位 第5回3位 第6回16位 第7回15位 第8回25位 第9回15位 第10回31位 第11回46位 第12回28位 第13回15位 2010年8位 2020年101位(DE) 第2回任天堂11位 RPGバトル2位 歴代15位 | |
| 帝都アグニラータ | 帝都アグニラータ | 第5回233位 第6回572位 第9回745位 第12回953位 2010年144位 町曲149位 ダンジョン120位 | |
| 帝都アグニラータ / 夜 | 帝都アグニラータ 夜 | ダンジョン407位 | |
| 中央工廠 | 中央工廠 | ダンジョン31位 | |
| イレギュラーバウンド | 機神界通常戦闘曲その２ （エネミーに感知されたor「おびきよせ」使用時） |
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| 巨神胎内 / 骸 | 清田愛未 | 巨神胎内（機神界中枢クリア前） | |
| 巨神胎内 / 鼓動 | 巨神胎内（機神界中枢クリア後） | ||
| 最後の戦いへ | ACE+ | 監獄島（機神界中枢クリア後） | ダンジョン93位 |
| 記憶の果て… | 清田愛未 | 記憶空間 | |
| ザンザの世界で | ACE+ | 記憶空間通常戦闘曲 | |
| コロニー6 ～未来～ | 清田愛未 ACE+ |
コロニー6(復興度75%～100%) | |
| ゼノブレイド ディフィニティブ エディション追加曲 | |||
| 巨神肩 | ACE | 2020年61位 | |
| 戦いの刻 | 平松建治 | 追加ストーリー「つながる末来」戦闘曲 | 2020年3位 |
| 霧乃獣 | ACE | 霧乃獣戦 | 2020年2位 |
| 古代都市グランデル | 清田愛未 | ||
| 巨神肩 / 夜 | 仮曲名 | ||
| 古代都市グランデル / 夜 | |||
| ラスボス戦 | |||
| Beyond the Sky (Acoustic Arrange) | 光田康典 | 「つながる未来」エンディング | |
