| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| アトランティスの子供達(アレンジヴァージョン) | 酒井省吾 濱田誠一 |
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| 果てなき望み～旅の始まり～ | 酒井省吾 清水絵美 岩崎正明 |
タイトル | |
| 神の膝元 | 酒井省吾 | 神殿 | |
| チャイム | 酒井省吾 | 学校ジングル | |
| アトランティスの思い出 | 酒井省吾 | アトランティス | 癒し174位 |
| 不思議の入手 | 酒井省吾 | 重要アイテム | |
| 嵐の訪れ～ト短調～ | 安藤美穂子 | アトランティス襲撃時 | |
| 襲撃 | 濱田誠一 酒井省吾 |
過去編戦闘 | |
| 友逝きて | 安藤美穂子 | 学友の死 | |
| まどろみ | 酒井省吾 | 宿屋 | |
| 鉱山の底へ | 安藤美穂子 | オリハルコン鉱山 | |
| 未知ヘの不安 | 岩崎正明 | アールモアの研究室 | |
| 思惑～時の行く先～ | 清水絵美 | パンドラの箱 | |
| 地平線の彼方 | 酒井省吾 | 前半フィールド | 第2回165位 第3回182位 第13回748位 SFC227位 フィールド90位 |
| 魔物たちとの戦い | 酒井省吾 | 通常戦闘 | |
| 勝利の高鳴り | 清水絵美 | 戦闘勝利 | |
| 野の片隅で | 安藤美穂子 | 村 | |
| ぜんぶ好き | 濱田誠一 | イマンドラの子供が歌う歌 作詞：野島一成 歌：エル（嘉納亮子の中の人） |
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| 探索 | 安藤美穂子 | ダンジョン | |
| 出会い | 酒井省吾 | 仲間加入 | |
| 死闘 | 桃井聖司 | ボス戦 | |
| 思いは深く | 酒井省吾 | ヘラクレス復活 | |
| 思いのほころび | 酒井省吾 | アトランティス | |
| 小波の揺れる所 | 清水絵美 | サンタレン | |
| 永遠への望み | 清水絵美 | トランティア | |
| 大海原を行く | 清水絵美 | 船旅 | |
| 女王様のお通り | 安藤美穂子 | テーベ・ビゼルト | |
| 砂の行方 | 清水絵美 | サーバ | |
| 働き手たち | 酒井省吾 | 工事現場 | |
| いにしえのお誘い | 酒井省吾 | ピラミッド | |
| 呪いの宝箱 | 酒井省吾 | 呪いの宝箱 | |
| 別れ | 酒井省吾 | 仲間脱退 | |
| 街に集いて | 清水絵美 | アテネ・スパルタ | |
| 小さな指人形 | 濱田誠一 | 竪琴演奏 - 童謡（ゲーム後半） | |
| ぜんぶ好き (竪琴バージョン) | 濱田誠一 | 竪琴演奏 - 童謡（ゲーム前半） | |
| 果実の木の下で | 濱田誠一 | 竪琴演奏 - 流行り歌（ゲーム後半） | |
| 夕陽 | 濱田誠一 | 竪琴演奏 - 流行り歌（ゲーム前半） | |
| 黄昏の調べ | 濱田誠一 | 竪琴演奏 - 神々の歌（ゲーム前半） | |
| 力の響き | 濱田誠一 | 竪琴演奏 - 神々の歌（ゲーム後半） | |
| ペルシアの踊り | 安藤美穂子 | ペルシア | |
| 生命なき者の国 | 酒井省吾 | 冥界 | |
| 死の王の居城 | 酒井省吾 | ハデスの城 | |
| 果てなき償いの地にて | 岩崎正明 | タルタロス | |
| 遠い記憶 | 安藤美穂子 | パリスの正体 | |
| 新たなる空 | 酒井省吾 | 後半フィールド | フィールド193位 |
| マケドニア王の嘆き | 安藤美穂子 | サンドリア | |
| 崩壊の都市 | 酒井省吾 | トロイ | |
| 戸惑いの再会 | 酒井省吾 | 未使用曲 | |
| おしごと…ダンス | 酒井省吾 | 海底船完成 | |
| 深海～ポセイドンの世界 | 酒井省吾 | 深海 | |
| アトランティスの子孫 | 酒井省吾 | アトラシア | |
| 風の渦巻く山 | 清水絵美 | アトラス山 | |
| 畏怖 | 酒井省吾 | アトラス | |
| ペガサスの翼 | 酒井省吾 | ペガサス | |
| ゼウスの悪戯 | 酒井省吾 | 天界 | |
| 辿りゆく過去 | 安藤美穂子 | ラストダンジョン | |
| 真実 | 酒井省吾 | 未使用曲 | |
| 道のりの果て | 酒井省吾 | ラストイベント | |
| 試練～決意の交錯～ | 桃井聖司 | ラストバトル1 | |
| 終止符の戦い | 桃井聖司 | ラストバトル2 | |
| 旅の終わりに | 酒井省吾 桃井聖司 |
エンディング | |
| しばしの休息 | 酒井省吾 | クリア後の"TheEnd"表示時 | |
| 敗北 | 清水絵美 | 全滅 |
