ミニゲーム(BK2)

本編中でミニゲームが登場するほか、一度プレイしたミニゲームはリプレイモードで遊べるようになる。
ゲームによって同じ画面/分割画面でマルチプレイが可能。（マルチプレイは本編中でプレイしていないミニゲームでも遊べる。）

ターゲザンのしんでん/へいきそうこ/クリンカーズのどうくつでシューティング

キャラクター

	ライフ	速度	大きさ
バンジョー マンボ ジャムジャー	8	標準	標準
グランチルダ	16	遅い	大
ジンジョー※	4	速い	小

※ジンジョーを使うには、本編中でへッギーのタマゴ屋敷に最初からあるスペシャルなタマゴをカズーイ単独のあたためで孵化させる必要がある。

タマゴタイプ

タマゴわんさか	全種類
H&C	ノーマル・ファイアー・アイス
こっそり	ノーマル・ファイアー・センサー
ベイビー	ノーマル・アイス・ベイビー
バクレツ	ノーマル・アイス・ばくだん

※4ダースマッチとチキンマッチはタマゴタイプが選べず、「こてい」となる。

ゲームタイプ

ノーマルマッチ: 通常ルール。特に捻った点はない
ワンヒットマッチ: 1回のヒットでミス
4ダースマッチ: 48個のタマゴで命中率を競う
トリトリマッチ: 2チーム戦。3人なら1VS2、4人なら1VS3か2VS2で、チームは選択可。その性質上、2人では選択不可。ちなみに何故モード名が「トリトリ」かというと、英語では「Birdy Buddies」だからである。
チキンマッチ: 1人がオニになり、他のプレイヤーはオニを撃つとポイント。鬼役は一定時間逃げるごとに加点。

せんすいかんシューティング

本編とは違い相手を直接攻撃する。一定時間での獲得ポイントか、規定のポイントに到達したら勝利かのどちらかで行う。

みつばちシューティング

本編とは違い相手を直接攻撃する。一定時間での獲得ポイントか、規定のポイントに到達したら勝利かのどちらかで行う。

マヤヤンキックボール/コロシアムキックボール

ぶっつけカート

リングホッパー

バルーンゲーム

チョンパのおなか

ツウィンクリーズ・ゲーム

本編とは違い固定画面で行う。

ゴミばこチャレンジ

本編とは違い固定画面で行う。

タワーDEクイズ

一定時間での獲得ポイントか、規定のポイントに到達したら勝利かのどちらかで行う。
必ず4人（1P：マンボ、2P：ジャムジャー、3P：バンジョー、4P：ウンバ）で行うことになり、人数が空いている分はCPUが担当する。
開始時のグランチルダによるキャラ紹介がなかなか面白い。