図書館をクリア後、入れるようになる。B3Fに行くには、北山大学でシド戦を終えてから。
B3FのイベントA（米軍基地）では武器が買える。ただし基地内に入るには、中華街の事件を解決し、偽造IDカードを入手している必要がある。この米軍基地までの道のりは結構長く、一旦B5Fまで行き、上がってこなければ入れない。PSP版ではバグ技（無理矢理扉を開ける技）を使うことでショートカットが可能だ。
▲米軍基地には必ずしも行く必要はないが、特殊な銃弾を購入できるのが嬉しい。
B5FのイベントBは、デビルバスター・バスターズ。このイベントを起こしていない場合に限り、B4FのイベントCにデビルバスター・バスターズが登場する。途中選択肢が出てくるが、ストーリーに変化があったりするなどの影響はない。ただのお遊びイベント。
B2FのEXITは異界（エキストラダンジョン）へ続いている。通過条件は迷宮古墳にあり。ラストバトル直前でようやく入れる場所なので、序盤は無視していい。
B3Fの宝箱1の隣のEXITは雲雀ヶ丘に、中央東のEXITふたつはどちらも臨海公園の地下水道につながっている。宝箱2を回収するには、臨海公園の地下水道を経由しなければならない。
1 500MAG
2 ￥50000
3 宝玉
4 ￥10000
5 速さの香
6 チャクラドロップ
7 チャクラム
8 スタングレネード
LV2 妖精ピクシー
LV2 悪霊ポルターガイスト
LV3 屍鬼スケアクロー
LV4 地霊ノッカー
LV4 幽鬼ガキ
LV5 妖虫ウブ
LV6 魔獣カブソ
LV6 凶鳥ヒッポウ
LV7 妖鳥バー
LV8 妖精キジムナー
LV8 妖鬼ボーグル
LV7 夜魔ナハトコボルト
LV9 地霊コロポックル
LV9 堕天使ストラス
LV9 妖獣ワイラ
LV10 妖魔アガシオン
LV10 妖樹ジュボッコ
LV11 魔獣ヘアリージャック
LV13 夜魔キキーモラ
LV10 悪霊クイックシルバー
LV11 屍鬼ワックスワーク
LV12 幽鬼オバリヨン
LV13 妖虫ヨーウィー
LV14 天使エンジェル
LV14 邪鬼オーガ
LV15 妖精ジャックフロスト
LV15 凶鳥モー・ショボー
LV15 邪龍トウビョウ
LV16 妖鳥ヤマチチ
LV16 妖鬼ヤマワロ
LV16 妖獣アーヴァンク
LV17 魔獣カタキラウワ
LV17 堕天使メルコム
LV17 鬼女ヨモツシコメ
LV18 妖精ジャックランタン
妖精が多く出現するため、精霊ウンディーネを造るときに便利なダンジョン。順調に行けば妖鳥を2体、夜魔も2体集めることができ、精霊シルフと精霊ノームにリーチをかけることもできる。そのため、御魂造りにはなかなか使えるダンジョンだったりする。御魂を造りたいときはとりあえずこの地下水道をうろついて仲魔を集め、集まったメンツを見て次にどの地下水道に行くかを考えるといい。
