3 細菌感染症（抗酸菌〈マイコバクテリア〉を除く） 約30％
- A レンサ球菌感染症
- B 腸球菌感染症
- C 肺炎球菌感染症
- D ブドウ球菌感染症，メチシリン耐性黄色ブドウ球菌〈MRSA〉感染症
- E 淋菌感染症
-
F 髄膜炎菌感染症
- Waterhouse Friderichsen症候群
- G リステリア感染症
- H ジフテリア
- I 炭疽
-
J ヘモフィルス感染症
- インフルエンザ（桿）菌感染症，軟性下疳
- K モラクセラ カタラーリス感染症
- L 細菌性赤痢
-
M サルモネラ感染症
- 腸チフス，パラチフス，非チフス性サルモネラ症
- N 百日咳
- O 大腸菌感染症
- P 腸管出血性大腸菌感染症
- Q クレブシエラ感染症
- R セラチア感染症
- S エルシニア感染症
- T 腸炎ビブリオ感染症
- U コレラ
- V レジオネラ症
- W ペスト
- X 緑膿菌感染症
- Y 野兎病
- Z 鼻疽，類鼻疽
- AA ブルセラ症
- AB カンピロバクター感染症
- AC ヘリコバクター・ピロリ感染症
- AD 破傷風
- AE ガス壊疽
- AF ボツリヌス症
- AG クロストリジウム デイフィシル腸炎
- AH バクテロイデス感染症
- AI アクチノマイセス
- AJ ノカルジア
- AK レプトスピラ症
- AL 梅毒
