**システム変更点 ＧＢＡ版のシステムから変更された部分のまとめ（の予定）です。 *ＭＡＰ上 -ＤＳ内時計と連動して、朝～夜と時間帯が変わるように。 -特定時間帯でなければ出ないポケモンや、特定時間帯でなければ進化しないポケモンがいる。 -建物の中でもランニングシューズでダッシュできるようになった。 *アイテム -「持ち物」「戦闘用」等、アイテムの分類分けが増えた。 -所持数の限界が999個になった。 -カーソルの上下移動と決定ボタンはタッチパネル中央のボールでも操作可能に。 -主人公のパソコンにアイテムなどが預けられなくなっている。 *戦闘 -攻撃の物理・特殊がタイプ別ではなく技個別に設定された。 -なみのり、いわくだき等、一部の技の性能が調整された。 -野生ポケモンとダブルバトルで戦う場面が存在する。 -ＮＰＣと組んでダブルバトルする場面が存在する。この際には、ＨＰ、ＰＰ、戦闘不能含む状態異常等、全て戦闘終了時に全快にしてくれる。 -戦闘中にセレクトボタンでわざの並びを変更できなくなった。 変更する時はポケモンのステータス→わざ一覧から。 -全滅時のペナルティ金額が固定（段階的に増大）に。
