比良坂機関(ひらさかきかん)
比良坂流古神道を背景に持つ日本の諜報機関。政府とのつながりが強く、日本の国防、国益を最優先で遂行しようとする。政治力や経済力を背景とした陰謀や工作を得意とし、日本を守るために暗躍する。
比良坂機関下位流派
●常夜(とこよ)
条件：≪死霊術≫の特技を修得している。性別が女性。
流儀：死者たちの眠りを護る。
仇敵：世界忍者連合
比良坂流古神道の奥義を極めた巫女の集団です。死者たちの声を聞き、凶事や災厄を予言します。国政にも強い影響力を持つ、恐るべき死霊使いたちです。
条件：≪死霊術≫の特技を修得している。性別が女性。
流儀：死者たちの眠りを護る。
仇敵：世界忍者連合
比良坂流古神道の奥義を極めた巫女の集団です。死者たちの声を聞き、凶事や災厄を予言します。国政にも強い影響力を持つ、恐るべき死霊使いたちです。
●醜女衆(しこめしゅう)
条件：性別が女性。
流儀：男性に負けない。
仇敵：隠忍の血統、鞍馬神流
女性のみで構成された戦闘部隊。比良坂機関でも例外的に直接戦闘を得意としています。構成員はみな顔を隠しており、素顔を見られた相手を抹殺することで有名です。
条件：性別が女性。
流儀：男性に負けない。
仇敵：隠忍の血統、鞍馬神流
女性のみで構成された戦闘部隊。比良坂機関でも例外的に直接戦闘を得意としています。構成員はみな顔を隠しており、素顔を見られた相手を抹殺することで有名です。
●公安隠密局
条件：【沈黙】の忍法を修得している。
流儀：日本の国益を守る。
仇敵：ハグレモノ、私立御斎学園
日本政府内部にある比良坂の出先機関のひとつ。安全保障の目的で国内外の情報を収集・分析しています。主要な忍者がらみの事件は、彼らが調査、隠蔽を行います。
条件：【沈黙】の忍法を修得している。
流儀：日本の国益を守る。
仇敵：ハグレモノ、私立御斎学園
日本政府内部にある比良坂の出先機関のひとつ。安全保障の目的で国内外の情報を収集・分析しています。主要な忍者がらみの事件は、彼らが調査、隠蔽を行います。
●麝香会(じゃこうかい)総合病院
条件：≪毒術≫か≪九ノ一の術≫の特技を修得している。
流儀：愛と死を等しく与える。
仇敵：特になし
毒遣いと、全身に猛毒を宿すクノイチたちからなる流派です。表向きは政財界御用達の病院ですが、その実態はVIP専用の娼館にして麻薬窟です。
条件：≪毒術≫か≪九ノ一の術≫の特技を修得している。
流儀：愛と死を等しく与える。
仇敵：特になし
毒遣いと、全身に猛毒を宿すクノイチたちからなる流派です。表向きは政財界御用達の病院ですが、その実態はVIP専用の娼館にして麻薬窟です。
