ヒルコによれば、大国主の国譲り以来、大和の地は天津神が支配する地であったという（ここで出てくる「大国主」とは、地下世界で助けることになる国津神オオナムチのこと）。天津神が支配する時代は永く続いてきたものの、前世紀末、突如として世界中の悪魔が東京の各地で出没し始め、地上の霊的なバランスが崩れ始めた。
本来であれば大和の神々が一丸となって、これら悪魔の活動を食い止めるべきであったのだが、支配される側であった国津神たちはこの混乱に乗じ、ヘブライ神族の力を借りて反乱を起こす。結果、国津神は天津神を封印し、大和における支配構造の逆転を勝ち得た。しかし天津神という巨大な勢力がひとつ消えたことは、天津神と国津神、どちらも倒さねばならぬと考えていたヘブライ神族にとっては、好都合であった。ヘブライ神族はこのときとばかりに国津神を裏切り、背後から攻撃をしかける。虚を突かれた国津神たちに、勝ち目はなかった。そしてヘブライ神族は国津神の封印に成功、東京の守護神であった平将門公も身体を引き裂かれ、東京を護っていた霊性エネルギーは完全に喪失。こうして大和の地に新たな支配者が君臨するに至った。
アマテラスが封印されている「封印の岩戸」は、旧東京で言えば皇居に当たる。さらにTOKYOミレニアムの位置関係で言えば、センターの真下が皇居なのだ。つまりセンターは、センター自身が大和の支配神たる天津神封印の役目を負っているのである。この封印を解くことができるのは将門公であり、あなたというわけだ。ヒルコから将門公復活を依頼されたら将門公の身体をすべて集め、邪教の館で合体させたのち、旧六本木のヒルコのもとへいって公の御霊を入れれば、将門公は完全復活する。
大教会3Fにいるストーカーから買うか脅して奪い取る。属性にかかわるイベントになっているので注意が必要である。
旧水道橋の祠にいる国津神コトシロヌシが持っている。石化を解いてあげるともらえる。
旧渋谷の祠に封印されている国津神オオナムチを助けるともらえる。
旧六本木の西の祠に封印されている国津神サルタヒコを正気に戻すともらえる。
旧大手町の祠、国津神スクナヒコナを助け出すともらえる。
旧麹町の祠、国津神オオヤマツミを助け出すともらえる。
封印されていた国津神たちを助け出せば、彼らを悪魔合体で造れるようになる。同様に、封印の岩戸に封印されていた天津神たちも、助け出すことで悪魔合体にて造れるようになる。
魔界へ行くために集めることとなるピラーは、ただの柱なのではなく、呪術的な力を秘めた祭具である。雄々しく直立するその造形は男根を想像させる。もしかしたら、男根崇拝に何らかのヒントがあるのかもしれない（魔界にもアレがあるし…）。
魔界には行くにはピラーだけでなく、花田の人形を使っても行くことができるが、これはいわば裏口から入るようなもので、正式なものではない。ちなみに人形を使って魔界に入るには、大教会2Fにいる男から“眠る人形”を譲ってもらい、大教会3Fの儀式の部屋で“踊る人形”以外の人形を使えばいい。
ピラーを全て集めたら、地下世界のアルターストーンにセットしていく。すべてのピラーをセットすれば、人面岩が出現し、そこから魔界に飛ぶことができる。
将門公を完全復活させたあと、封印の岩戸で将門公から授かる。
ホーリータウンのディスコで満月の夜におこなわれるレイヴパーティーで優勝するともらえる。優勝にはあなたの魔力が10必要（装備品や酒のアビリティボーナス有効）。
ヴァルハラ通路でダレスを倒すと、ダレスが落としていく。
復興したホーリータウンのジャンク屋に出入りするともらえる。
ファクトリーの監視塔にいるセイレーンの歌を止めると、発掘現場のベテルギウスの場所にいる労働者が譲ってくれる。
大教会のとなりに魔王モロクの尻尾が出現したあと、旧六本木のミュータントの長老に会いに行くともらえる。
地下世界の旧市ヶ谷の発掘現場でドワーフの仕事を手伝うと、お礼にもらえる。
面倒なのは月のピラーか。魔力を全く上げてなくて…なんてことのないように、序盤のうちにある程度あげておく。金星のピラーも少々分かりにくいかもしれない。他はしっかりと情報集めをしておけば分かるレベルだ。
おそらく、アマテラスを解放した時点でレベルは35ぐらいまでは上がっているはず。ここまでくると魔神や破壊神も造れるには造れるが、しかしただ造っただけでは面白くないし、これからのボス戦は辛いだろう。今後はある程度魔法継承を意識した悪魔合体をおこなうと、俄然ボス戦が楽になる。
▲魔法継承のおかげでかなり役立つ仲魔に。あとはレベルの問題。
たとえば左の女神フレイア。フレイア本来の所持魔法は、ドルミナー、マリンカリン、タルカジャ、サバトマ、ネクロマというラインナップで、女神で唯一回復魔法を所持していないという、ある意味扱いに困る悪魔なのだが、魔法継承をほどこせばこの通り、回復も補助もバッチリこなせるというスーパーキャラに変身させることができる。レシピは簡単で、大天使ハニエルと鬼女アルケニーを合体させるだけだ。
- 夜魔ヴァンパイア＋妖魔テング＋地霊ツチグモ＝地母神ハリティー…A
- A＋天使アークエンジェル＝大天使ハニエル…B
- B＋鬼女アルケニー＝女神フレイア
実はこの合体では本来フレイアが持つマリンカリンがバグ？で消えてしまい、代わりにラクカジャを継承する（したがって、他機種版では無理）。さてこのように、回復とサポートを兼ねる悪魔がひとり、また破壊神アレスのような、攻撃とサポートを兼ねる悪魔をひとり合体で仲魔にしておくと、今後のボス戦はすこぶる楽になるだろう。
▲有無を言わさず死ぬまで働かせる…それもセンターの真実のひとつ。
封印の岩戸で天津神たちを解放したあとは、ホーリータウンに足を運ぶ。すると、またもザインが一騒動起こしているはずだ。どうやらファクトリーで働かされている労働者たちを、センターの手から解放するらしい。
街頭TVでザインの主張を聞き、街の外でザインと会ったら、あなたもファクトリーの強制収容所へ急ごう。強制収容所は、発掘現場を経由して入ることができるのだが、道は覚えているだろうか？
強制収容所では投獄されている人たちを助けようとするも、どうも彼らの様子がおかしい。まるでヒロコを助け出したときのように、こちらの言うことを聞いてくれない。その様子を見て、ザインはファクトリーの北に建てられている塔が怪しいことに気付く。あなたもザインのあとを追って、監視塔へ入ろう。
▲秘密とは何か？それを、あなた自身の目で確かめて欲しい。
……しかし監視塔に行く前に、ザインには悪いのだが、ミレニアムや地下世界をブラリと回ってみるのもいい。BARやメッセンジャーの台詞が色々と変化しているのに気付くはずだ。
特に左の彼。ある街にいるのだが、覚えているだろうか？この労働者からは、某所で使うことになるパス・コードを得ることができる。重要な情報なので、必ず会っておこう。
