1997年にナツメが開発、イマジニアから発売されたRPG。漫画家ほるま・りん原作でコミックボンボンとのメディアミックス展開を行っていた。
当時大流行したポケモンの、いわゆる二匹目のドジョウを狙ったゲームで、収集・育成・通信対戦を売りにして、
2バージョン同時発売、携帯型ゲーム機の通信機能を使った交換・対戦が可能なRPG。
しかし、ポケモンよりもよりストーリーに重点が置かれている。
斬新なメダロットのデザイン、個性的なキャラクター、熱くもあり、それでいてさまざまなテーマを含んだ深いストーリーなどが高い人気を博した。
コミックボンボンでは漫画版も連載され、ほるま・りん版と藤岡建機版が連載された。
原作にあたるほるま・りん版は、生命のあり方やメダロットという存在が起こす様々な事象を題材とし、
他のメディアに比べ熱さで劣るがブラックで硬派なSF作品的な趣があるのが特徴。
一方の藤岡建機版はロボットアクションやサービスシーンをふんだんに取り入れたエンターテイメント性の高い内容だが、
『メダロットNAVI』は対照的に叙情的な作品となっている。
（余談だが当時のボンボンは、やたらエロかったり、子供には到底わからないようなパロディやブラックなネタがあったり、鬱展開があったりと、
とても子供向けとは思えないかなりカオスな漫画も多かった。）
アニメ版も製作され、これまた高い人気を博した。聞いてるだけでテンションあがってくる熱いOP曲は有名。
ニコニコでも無料配信が開始されたので、興味がある人はぜひ視聴をおすすめする。
その人気に応えアニメ版は続編『メダロット魂』も製作された。
が、人気キャラクター大量リストラに対して言及なし、ダーク路線気味になったことなどが原因で人気は落ち込んでしまった。
また、特徴的なシステムとして、原作と同じくパーツごとに耐久値が設定されており、それぞれのパーツが破壊されると対応した必殺技が封印される。
脚部の場合はダッシュとバックステップが使用不可となる。
頭部の破壊＝機能停止であるため、頭部には部位破壊が存在しない。
かといって
頭部にしかライフを減らせる判定がないのかと言えばそういうわけでもなく、どこの部位でもダメージは普通に通る。
