| 話数 | タイトル | 登場人物 |
| 009 | 凸凹コンビ結成 | 徳川吉宗、秋山小兵衛 |
| 016 | 剣聖の決意、狂犬の末路 | 上泉信綱、岡田以蔵 |
| 019 | 剣を失いし剣士達 | 斉藤伝鬼坊、細谷源太夫、石川五ェ門 |
| 029 | 剣が主か主の剣か | 白井亨、柳生連也斎 |
| 034 | 狼狗相食む | 佐々木只三郎、斉藤一 |
| 041 | 魔境転生 | 柳生十兵衛、三合目陶器師、志村新八 |
| 049 | すれ違う思惑 | 新見錦、桂ヒナギク、沖田総司、犬塚信乃(男)、足利義輝 |
| 053 | 失われた剣を求めて | 瀬田宗次郎、東郷重位 |
| 064 | 妖怪たちの饗宴 | 志々雄真実、久慈慎之介、トウカ、千葉さな子、緋村剣心、神谷薫、座波間左衛門、三合目陶器師 |
| 067 | 名刀妖刀紙一重 | 小野忠明、佐々木小次郎(傷)、新免無二斎 |
| 068 | 戦慄の活人剣 | 上泉信綱、林崎甚助、服部武雄 |
| 071 | 束の間の邂逅 | 土方歳三、山南敬助、烏丸与一 |
| 074 | 一人脱落、一人参戦 | 坂本龍馬、屈木頑乃助、斉藤一、富士原なえか |
| 077 | か細い絆 | 中村主水、明楽伊織、倉間鉄山 |
| 078 | 偽りの再会 | 富田勢源、佐々木小次郎(偽) |
| 079 | 焦燥の中で | 塚原卜伝、宮本武蔵、伊烏義阿 |
| 081 | 霊珠に導かれて | 岩本虎眼、藤木源之助、柳生連也斎、高坂甚太郎 |
| 082 | 活人剣の道険し | 上泉信綱、林崎甚助、武田赤音、神谷薫、岡田以蔵、緋村剣心 |
| 083 | すれ違う師弟 | 小野忠明、斎藤弥九郎、千葉さな子 |
| 084 | 忠誠いろいろ | 奥村五百子、佐々木只三郎、犬坂毛野 |
| 085 | 修羅の道行き | 久慈慎之介、トウカ、志々雄真実、山南敬助、烏丸与一 |
| 087 | 夜明け前に | 徳川吉宗、秋山小兵衛、魂魄妖夢、椿三十郎、辻月丹 |
| 089 | ただ剣の為に | 赤石剛次、明楽伊織、倉間鉄山、中村主水、伊良子清玄、白井亨 |
| 091 | 迷いの剣 | 伊東甲子太郎、外薗綸花、川添珠姫、新見錦、服部武雄 |
| 092 | 有り得ざる邂逅 | 伊藤一刀斎、新免無二斎、東郷重位 |
| 093 | 日の出 | 近藤勇、土方歳三、三合目陶器師、果心居士、柳生宗矩、南光坊天海、徳川忠長 |
| 096 | 過失なき死 | 塚原卜伝、伊烏義阿、宮本武蔵、奥村五百子、犬坂毛野 |
| 097 | 波紋(前編) 波紋(後編) |
秋山小兵衛、徳川吉宗、魂魄妖夢、富田勢源、香坂しぐれ、果心居士、志々雄真実 |
| 098 | すれ違い続ける剣士達 | 芹沢鴨、沖田総司、石川五ェ門、細谷源太夫、桂ヒナギク、東郷重位、緋村剣心、神谷薫 |
| 101 | 義士達に更なる試練を | 足利義輝、犬塚信乃、剣桃太郎、坂田銀時、塚原卜伝、宮本武蔵、富田勢源、辻月丹 |
| 102 | 弟子と向き合う | 斎藤弥九郎、千葉さな子、宮本武蔵、高坂甚太郎 |
| 103 | 名刀の鞘 | 伊藤一刀斎、香坂しぐれ、椿三十郎、志々雄真実 |
| 104 | 技比べ | 芹沢鴨、桂ヒナギク、細谷源太夫、沖田総司、石川五ェ門、白井亨、柳生連也斎 |
| 105 | 待ち望んだ対決 | 小野忠明、柳生宗矩 |
| 106 | 三剣士、復活を志す | 近藤勇、土方歳三、佐々木小次郎(偽) |
| 107 | 主水、不運を嘆く | 明楽伊織、倉間鉄山、赤石剛次、中村主水、東郷重位 |
| 108 | 顔合わせ | 上泉信綱、武田赤音、宮本武蔵、柳生連也斎 |
| 109 | 悪夢の終わり | 柳生十兵衛、志村新八、オボロ、新免無二斎、佐々木只三郎、富士原なえか |
| 110 | 妖薙ぎの剣 | 秋山小兵衛、徳川吉宗、魂魄妖夢、志々雄真実 |
| 111 | 秘技伝授 | 塚原卜伝、足利義輝、犬塚信乃、剣桃太郎、坂田銀時 |
| 112 | 疾風の如く！ | 芹沢鴨、細谷源太夫、桂ヒナギク、沖田総司、石川五ェ門、志々雄真実、徳川吉宗、秋山小兵衛、魂魄妖夢、近藤勇、藤木源之助 |
| 113 | 選んだ道 | 柳生宗矩、明楽伊織、倉間鉄山、赤石剛次 |
| 114 | 義手と偽手 | 辻月丹、富田勢源、徳川吉宗、秋山小兵衛、魂魄妖夢、藤木源之助、香坂しぐれ、佐々木小次郎(偽)、細谷源太夫 |
| 115 | 燃え尽きるまで | 芹沢鴨、沖田総司、細谷源太夫、緋村剣心、神谷薫、志々雄真実 |
| 116 | 決戦前 | 新免無二斎、柳生十兵衛、オボロ、志村新八、赤石剛次、坂本龍馬、伊東甲子太郎 |
