001 タイトルバックの絵が変わる(ＯＰでスライド表示される横向きのゼロ)
002 ベースのいろんな箇所に鉢植え追加
003 エレベーターのデザインが丸太を組み合わせたものになる
004 ゼットセイバーのパワーが１アップ
005 ナース系エルフのサテライト装備時のデザインが◎から三のような感じに
006 ２階のホールに仲間１人増えてEクリスタルをもらえる
007 バスターショットの通常弾が真っ黒（１点ハイライトあり）に変わる
008 ゼットパネルの色が青に（形は変わらず）
009 アルエットの服が緑に（アンドリューのデザインだってよ）
010 メッセージウィンドウが灰色のパイプのようなモノに変化
011 メッセージウィンドウが青緑になって四隅に丸が付いたデザインに変化
012 ライフエネルギー（大）のデザインが ⊂●⊃ に変化
013 メッセージウィンドウが白フチのビックリカコミのようなものに変化
014 ２階のＡの部屋に女レジスタンス出現。１作目で牢獄から助けたキス女。選択肢で Eクリスタル入手
015 リコイルロッドのパワーが１アップ
016 改造をすべてリセットする
017 ベースのそこらかしらにネコが何匹も出現。会話もなにも無し
018 ベースの外がオープニングのように雪が降る
019 Eクリスタル（大小ともに）デザインが●に横線が数本入ったモノに変わる
020 シールドのパワーが１アップ
021 シエルの部屋の情報が読めるコンピューターが灰色のごっついモノに。内容は変わらず。
022 ベースの屋上にサイバーエルフ追加。ゼロ「気のせいかサイバー空間から呼びかけているような…」
023 バスターショットのパワーが１アップ。
024 ベースのそこらかしらに絵画が掛けられる。シエルとエグゼの２種類確認。
025 アンドリューの前に扉が追加。部屋の中にゼットパネル（１度ベースを出れば何度でも可）
026 バスターショットのパワーが2アップ
027 改造をすべてリセットする
028 シエルの部屋の情報が読めるコンピューターが自動販売機に変わる
029 ベースの屋上に花が数種類咲く。エンディングが花畑で綺麗なる
030 メッセージウィンドウが鋼色のネジみたいになって四隅に赤丸が付いたデザインに変化
031 シークレットディスクが濃い青色（微妙にデザイン変化）に変更
032 シールドのパワーが2アップ。
033 ２階の右の部屋がたくさんある通路に男レジスタンス出現。１作目で牢獄から助けた男。Eクリスタル入手
034 リコイルロッドのパワーが2アップ
035 タイトルの絵が１作目のゼロ復活の立ち絵（モノトーン）に変化
036 右監視塔の男の話が変化。オープニング～ミサイル基地・敵侵攻部隊迎撃～エリアＸ(018改造とセットで台詞)・エリアＸ攻略以降、と台詞が変わる
037 ２階のＢの部屋に男レジスタンス出現。Eクリスタル入手
038 ２階のＣの部屋に男レジスタンス出現。Eクリスタル入手。地下鉄の警備をしてた
039 ２階の通路に男レジスタンス出現。Eクリスタル入手
040 ゼットセイバーのパワーが2アップ
061 アーチム・アーチルの攻撃力がアップ アーチムとアーチルの攻撃力が基本値に＋３される
062 ハッカー系エルフのデザインが変わる もにょもにょした感じのデザインになる
063 バスターショットがパワーアップ バスターショットの攻撃力が基本値に＋３される
064 レジスタンスベースが夜になる 流れ星や星座が綺麗。エンディングには反映されない。Part1の雪と２択
065 シエルの部屋のコンピューターが変わる コンピューターがワイドテレビのようなデザインに変わる
066 シークレットディスクのデザインが変わる シークレットディスクが赤くなりデザインもちょっと変わる
067 メッセージウィンドウのデザインが変わる メッセージウィンドウが曲がったパイプのようなデザインになる
068 レジスタンスベースに鉢植えが置かれる ベースのそこかしこに白い花の鉢植えが出現する
069 メッセージウィンドウのデザインが変わる メッセージウィンドウが、漫画でキャラが驚いた時のふきだしのようなデザインになる
070 レジスタンスベースの港で魚が跳ねる １Ｆの右側にトビウオが出現する。バスター等で撃ち落とし続けると大Ｅクリスタル
071 リコイルロッドがパワーアップ リコイルロッドの攻撃力が基本値に＋３される
072 レジスタンスベースの３階に仲間が増える ３０ＥＣ
073 レジスタンスベースの３階に仲間が増える ５２ＥＣ
074 レジスタンスベースの３階に仲間が増える ４０ＥＣ
075 レジスタンスベースの３階に仲間が増える ３２ＥＣ
076 レジスタンスベースの３階に仲間が増える ５２ＥＣ
077 ライフエネルギーのデザインが変わる ライフエネルギーが [●] のような形に変わる
078 タイトルバックの絵が変わる タイトルバックの絵がシールドブーメランを投げているゼロの絵になる
079 ゼットセイバーがパワーアップ ゼットセイバーの攻撃力が基本値に＋３される
080 タイトルバックの絵が変わる タイトルバックの絵がシエルになる
002 ベースのいろんな箇所に鉢植え追加
003 エレベーターのデザインが丸太を組み合わせたものになる
004 ゼットセイバーのパワーが１アップ
005 ナース系エルフのサテライト装備時のデザインが◎から三のような感じに
006 ２階のホールに仲間１人増えてEクリスタルをもらえる
007 バスターショットの通常弾が真っ黒（１点ハイライトあり）に変わる
008 ゼットパネルの色が青に（形は変わらず）
009 アルエットの服が緑に（アンドリューのデザインだってよ）
010 メッセージウィンドウが灰色のパイプのようなモノに変化
011 メッセージウィンドウが青緑になって四隅に丸が付いたデザインに変化
012 ライフエネルギー（大）のデザインが ⊂●⊃ に変化
013 メッセージウィンドウが白フチのビックリカコミのようなものに変化
014 ２階のＡの部屋に女レジスタンス出現。１作目で牢獄から助けたキス女。選択肢で Eクリスタル入手
015 リコイルロッドのパワーが１アップ
016 改造をすべてリセットする
017 ベースのそこらかしらにネコが何匹も出現。会話もなにも無し
018 ベースの外がオープニングのように雪が降る
019 Eクリスタル（大小ともに）デザインが●に横線が数本入ったモノに変わる
020 シールドのパワーが１アップ
021 シエルの部屋の情報が読めるコンピューターが灰色のごっついモノに。内容は変わらず。
022 ベースの屋上にサイバーエルフ追加。ゼロ「気のせいかサイバー空間から呼びかけているような…」
023 バスターショットのパワーが１アップ。
024 ベースのそこらかしらに絵画が掛けられる。シエルとエグゼの２種類確認。
025 アンドリューの前に扉が追加。部屋の中にゼットパネル（１度ベースを出れば何度でも可）
026 バスターショットのパワーが2アップ
027 改造をすべてリセットする
028 シエルの部屋の情報が読めるコンピューターが自動販売機に変わる
029 ベースの屋上に花が数種類咲く。エンディングが花畑で綺麗なる
030 メッセージウィンドウが鋼色のネジみたいになって四隅に赤丸が付いたデザインに変化
031 シークレットディスクが濃い青色（微妙にデザイン変化）に変更
032 シールドのパワーが2アップ。
033 ２階の右の部屋がたくさんある通路に男レジスタンス出現。１作目で牢獄から助けた男。Eクリスタル入手
034 リコイルロッドのパワーが2アップ
035 タイトルの絵が１作目のゼロ復活の立ち絵（モノトーン）に変化
036 右監視塔の男の話が変化。オープニング～ミサイル基地・敵侵攻部隊迎撃～エリアＸ(018改造とセットで台詞)・エリアＸ攻略以降、と台詞が変わる
037 ２階のＢの部屋に男レジスタンス出現。Eクリスタル入手
038 ２階のＣの部屋に男レジスタンス出現。Eクリスタル入手。地下鉄の警備をしてた
039 ２階の通路に男レジスタンス出現。Eクリスタル入手
040 ゼットセイバーのパワーが2アップ
061 アーチム・アーチルの攻撃力がアップ アーチムとアーチルの攻撃力が基本値に＋３される
062 ハッカー系エルフのデザインが変わる もにょもにょした感じのデザインになる
063 バスターショットがパワーアップ バスターショットの攻撃力が基本値に＋３される
064 レジスタンスベースが夜になる 流れ星や星座が綺麗。エンディングには反映されない。Part1の雪と２択
065 シエルの部屋のコンピューターが変わる コンピューターがワイドテレビのようなデザインに変わる
066 シークレットディスクのデザインが変わる シークレットディスクが赤くなりデザインもちょっと変わる
067 メッセージウィンドウのデザインが変わる メッセージウィンドウが曲がったパイプのようなデザインになる
068 レジスタンスベースに鉢植えが置かれる ベースのそこかしこに白い花の鉢植えが出現する
069 メッセージウィンドウのデザインが変わる メッセージウィンドウが、漫画でキャラが驚いた時のふきだしのようなデザインになる
070 レジスタンスベースの港で魚が跳ねる １Ｆの右側にトビウオが出現する。バスター等で撃ち落とし続けると大Ｅクリスタル
071 リコイルロッドがパワーアップ リコイルロッドの攻撃力が基本値に＋３される
072 レジスタンスベースの３階に仲間が増える ３０ＥＣ
073 レジスタンスベースの３階に仲間が増える ５２ＥＣ
074 レジスタンスベースの３階に仲間が増える ４０ＥＣ
075 レジスタンスベースの３階に仲間が増える ３２ＥＣ
076 レジスタンスベースの３階に仲間が増える ５２ＥＣ
077 ライフエネルギーのデザインが変わる ライフエネルギーが [●] のような形に変わる
078 タイトルバックの絵が変わる タイトルバックの絵がシールドブーメランを投げているゼロの絵になる
079 ゼットセイバーがパワーアップ ゼットセイバーの攻撃力が基本値に＋３される
080 タイトルバックの絵が変わる タイトルバックの絵がシエルになる
