| + | ここを展開 |
| 会話イベント | 合計値・入手アイテム | |||
| Mission No.01 『始動』 | ||||
| Mission No.02 『灼熱の砂塵』 | ※ ビガザウロの知識（入手フラグ） | |||
| Mission No.03 『反撃の狼煙』 | ※ ビガザウロ 入手 | |||
| Mission No.04 『破滅の魔獣』 | ||||
| Mission No.05 『炎の報復者』 | ||||
| ステージクリア時１ | ① 連絡を取るんだ | （+11） | ||
| ② まさか･･･撃破されたのか？ | （+4） | |||
| ③ あたりを捜索しよう | （+8） | |||
| ステージクリア時２ | ④ とにかく基地に向かおう | （+4） | 最大（15） | |
| ⑤ ･･･弱ったな | （+1） | 最低（5） | ||
| Mission No.06 『スリーパー』 | ※ コマンドウルフAT装備型(アイン) 初登場 | |||
| コマンドウルフAT （アイン）出現時１ |
① 大丈夫か!? | （+11） | ||
| ② いったい何者だ？ | （+6） | |||
| コマンドウルフAT （アイン）出現時２ |
③ それは無理だ | （+1） | ||
| ④ なんとか助ける | （+6） | |||
| ステージクリア時 | ⑤ 何か悪い予感がする | （+4） | 最大（36） | |
| ⑥ ともかく、安全な場所を探そう。 | （+2） | 最低（14） | ||
| Mission No.07 『オーガノイド・システム』 | ※ アイン生存・死亡で今後の増援タイミングが分岐 | |||
| Mission No.08 『追跡者を追撃せよ』 | ※ アイン生存・死亡で今後の増援タイミングが分岐? | |||
| 会話イベント | 合計値・入手アイテム | |||
| Mission No.09 『サイレント・バトル』 | ||||
| ステージクリア時 | ①そうしよう | （+6） | 最大（47） | |
| ② いや、妨害電波ゾイドを叩く （※ 次話に【挟撃作戦】が追加） |
（+11） | 最低（20） | ||
| Mission No.10 『虐殺竜の脅威』 | ||||
| Mission No.11 『再会』 | ||||
| ステージ開始時 | ① よくご無事で･･･！ | （+11） | 最大（58） | |
| ② 今まで、 どうしておられたのですか |
（+8） | 最低（28） | ||
| （48ポイント以上?）※前作引継ぎあり時 | ||||
| （55ポイント?）以上で 第X章『覚醒のゼロ』が発生 ※ 特定の条件下で、さらに増援が出現 | ||||
| Mission No.12 『閃光の剣』 | ||||
| Mission No.13 『昏き森林防衛網』 | ※ アイン生存ルート：ケーニッヒウルフ(アイン)が登場 | |||
| ※ アイン死亡ルート：ケーニッヒウルフ(アルティシア)が登場 | ||||
| Mission No.14 『魔装竜・光臨』 | ||||
| Mission No.15 『真なるものの胎動』 | ||||
| デススティンガー 出現時 |
① 絶対に倒さなけれれば･･････！ | （+6） | ||
| ② なんて凶々しい･･････ | （+3） | 最大（64） | ||
| ③ いったい、何を･･････？ | （+1） | 最低（29） | ||
| 会話イベント | 合計値・入手アイテム | |||
| Mission No.16 『嵐を呼ぶ前哨戦』 | ※ アイン死亡ルート：トリニティライガー(アルティシア)が登場 | |||
| Mission No.17 『眠りの要塞』 | ||||
| ステージクリア時 | ① お前では勝てない | （+2） | 最大（70） | |
| ② ･･･もう よすんだ | （+6） | 最低（31） | ||
| Mission No.18 『陥落! ニクシー基地』 | ※ この回までに 第X章 が発生していない場合、 ステージ開始時にイベントが発生し、 ライガーゼロ と バーサークフューラー がマップに出現? | |||
| ステージ開始時 | ① レイハルト･･････!! | （+2） | 最大（76） | |
| ② よすんだ！ 戦いはもう･･････！ | （+6） | 最低（33） | ||
| Mission No.19 『砕かれた縛鎖』 | ※ 規定ポイント以上?：イエーガー、パンツァーが登場 | |||
| ※ 規定ポイント以下?：イエーガー、シュナイダーが登場 | ||||
| Mission No.20 『コア強奪』 | ※ アイン生存ルート：トリニティライガー(アイン)が登場 | |||
| ステージ開始時 | ① そんな･･･クラッツ少佐が･･･！ | （+4） | ||
| ② ともかく、少佐を追おう | （+5） | 最大（81） | ||
| ③ こうなるような気がしたんだ | （+1） | 最低（34） | ||
| Mission No.21 『ソウル・エクスチェンジ』 | ※ アイン生存ルート：ウルトラザウルス(アルティシア)が登場 | |||
| ステージ開始時１ | ① どうしてこんな･･･ | （+1） | ||
| ② うそだと言ってください | （+4） | |||
| ステージ開始時２ | ③ しっかりするんだ | （+3） | 最大（89） | |
| ④ あいつを･･･止める | （+4） | 最低（38） | ||
| 会話イベント | 合計値・入手アイテム | |||
| Mission No.22 『死が大地を覆うとき』 | ||||
| ステージクリア時 | ① ともかく･･･基地に戻ろう | （+2） | ||
| ② ･･･希望を捨てるな！ | （+4） | 最大（95） | ||
| ③ 奴らの好きにはさせない | （+6） | 最低（40） | ||
| Mission No.23 『ゼネバスの後継者』 | ||||
| ステージ開始時１ | ① ここで･･･何をしている | （+2） | ||
| ② 知っているのか、レイハルト | （+4） | |||
| ステージ開始時２ | ③ お前は･･･許さない！ | （+6） | ||
| ④ 何が目的だ | （+9） | |||
| ステージクリア時 | ⑤ お前のせいじゃない | （+5） | 最大（113） | |
| ⑥ しかたのないことだ | （+1） | 最低（49） | ||
| Mission No.24 『戦いの果てに』 | ||||
| Mission No.25 『終局の地』 | ||||
| 遺跡奥での ライバル出現時 |
① そうかもしれない | （+6） | ||
| ② 国なんて関係ない | （+9） | |||
| ステージクリア時 | ① そうだな･･･ やっと、終わった･･･ （※ そのままエンディングへ） |
（+5） | 最大（127） | |
| ② しかし･･･払った犠牲は大きい （※ ステージ26へ） |
（+1） | 最低（56） | ||
| ※ ライバル出現前に 最初のデススティンガーを倒すとエンディング? | ||||
| Mission No.26 『破滅を撒くもの』 | ※ 規定ポイント以下だと②選択でもエンディング? | |||
| 会話イベント | 合計値・入手アイテム | |||
| Mission No.01 『始動』 | ||||
| Mission No.02 『誇りを胸に』 | ||||
| Mission No.03 『敵陣包囲網を突破せよ』 | ||||
| Mission No.04 『メルクリウスの王者』 | ※ レッドホーン(ギュデム) 救助 | |||
| Mission No.05 『破滅の魔獣』 | ||||
| 2ターン目 開始時 | ① デスザウラーを撃破する 勝利条件：デスザウラーの撃破 |
（+6） | ||
| ② ここから離脱する 勝利条件：オリンポス山からの撤退 |
（+2） | |||
| ステージクリア時 | ③ ･･･隊長の代理を務めよう | （+6） | 最大（12） | |
| ④ 隊長はきっと、生きている | （+4） | 最低（6） 1ターン目に倒せば最低(4)? | ||
| Mission No.06 『報復は愛と友情のために』 | ||||
| ステージクリア時 | ① わかった | （+2） | ||
| ② しかし･･･まだ･･･ | （+4） | 最大（18） | ||
| ③ なぜ助けてくれる･･･？ | （+6） | 最低（8） | ||
| Mission No.07 『オーガノイド・システム』 | ||||
| 会話イベント | 合計値・入手アイテム | |||
| Mission No.08 『虐殺竜の脅威』 | ※ グスタフ(スパイ)を見逃す ⇨ ライジャー入手フラグ①? | |||
| ※ グスタフ(スパイ)を見逃さない ⇨ ブースターセットを入手 | ||||
| ※ 3周目以降はライジャー入手に影響しない? | ||||
| Mission No.09 『謀略の森』 | ※ レッドホーン(ギュデム)と共闘 | |||
| ステージ開始時 | ① 階級なんて関係ない | （+6） | 最大（24） | |
| ② やめてくれ | （+3） | 最低（11） | ||
| Mission No.10 『ジェノサイドアサルト』 | ||||
| Mission No.11 『力への道』 | ||||
| ステージ開始時 | ① 大丈夫だ | （+6） | ||
| ② すまない | （+4） | |||
| 2ターン目 開始時 | ③ 君は下がるんだ | （+6） | 最大（36） | |
| ④ 気をつけるんだ | （+4） | 最低（19） | ||
| セイバータイガーの フィギュア入手時 |
⑤ 好きだ | 第08話でグスタフ (スパイ) を 見逃さなかった ⇨ レイズシールド 見逃していた ⇨ セイバータイガーのフィギュア （※ 左の選択肢へ） | ||
| ⑥ あんまり･･････ | ||||
| ※ ⑤選択でライジャー入手フラグ②? ※ 3周目以降はライジャー入手に影響しない? | ||||
| Mission No.12 『魔装竜・光臨』 | ||||
| ステージ開始時 | ① 心配は いらない。 | （+6） | ||
| ② 君こそ大丈夫か？ | （+4） | |||
| 【A】2ターン目 敵増援 出現時 |
③ おのれ、やつらめ （➞【B】） |
（+4） | ||
| ④ やつらが･･･現れたのか･･･ | （+1） | |||
| 【B】③を選択後 | ⑤ そうだ、隊長の仇だ （➞【C】） |
（+1） | ||
| ⑥ ただの･･･ 倒さなければならない敵だ |
||||
| 【C】⑤を選択後 | ⑦ だが････････ | （+5） | 最大（52） | |
| ⑧ 心配は いらない。 | （+1） | 最低（24） | ||
| Mission No.13 『遭遇！ 真オーガノイド』 | 通常：マップ左上で コマンダーセット 入手 ※ 第11話で⑤を選択していた場合 ⇨ ライジャー入手イベント | |||
| 8ターン目 開始時 | ① 君は、迷っているな･･････ | |||
| ② こんなのは････間違っている。 | ||||
| Mission No.14 『偽りの英雄』 | ||||
| ステージクリア時 | ① 皆が変わったわけじゃあない。 | |||
| ② そうかもしれない | ||||
| ※ （29ポイント以上?）で 第X章『バーサークフューラー』出現 | ||||
| 会話イベント | 合計値・入手アイテム | |||
| Mission No.15 『タクティクス・オーシャン』 | ||||
| Mission No.16 『プロイツェン・ナイツ』 | ||||
| Mission No.17 『戦士の帰還』 | ※ （40ポイント）以上?：ジェノハイドラ(ギュデム) 登場 | |||
| ※ （40ポイント）以下?：レドラーキャノン(ギュデム) 登場 | ||||
| Mission No.18 『眠りの要塞』 | ||||
| ※初回ブリーフィング時 | ① 信用に足る人物だ | ※ ②選択時かつ（40ポイント）以上?： ➞ 数ターン目に敵が出現。 (マップに散らばる残骸を回収する猶予がある) | ||
| ② 謎めいた人物だ | ※ ①選択時 または （40ポイント）以下で ②選択時?： ➞ 1ターン目から敵が出現 | |||
| ステージクリア時 | ③ 復讐のためだ。 | |||
| ④ 目的はお前じゃない。 | ||||
| Mission No.19 『ニクシー基地防衛戦』 | ※ この回までに 第X章 が発生していない場合、 ステージ開始時にイベントが発生し、 ライガーゼロ と バーサークフューラー がマップに出現 | |||
| Mission No.20 『飛竜十字の誓い』 | ||||
| Mission No.21 『マッド・オーバーロード』 | ※（40ポイント）以下だった場合は デスステ入手イベントが発生しない? （40ポイント）で未発生 （41ポイント）でイベント発生確認 | |||
| ステージクリア時 | ① わかった （デススティンガーを入手） |
（+1） | 最大（60?） | |
| ② それはできない | （+8） | 最低（25?） | ||
| Mission No.22 『死が大地を覆うとき』 | ||||
| ステージクリア時 | ① ともかく･･･拠点へ戻ろう | （+2） | ||
| ② しっかりするんだ | （+4） | 最大（66） | ||
| ③ 奴らを･･･止める | （+6） | 最低（27） | ||
| 会話イベント | 合計値・入手アイテム | |||
| Mission No.23 『ゼネバスの後継者』 | ||||
| ステージ開始時１ | ① 一体、何を････ | （+2） | ||
| ② 知っているのか、ウェイン？ | （+4） | |||
| ステージ開始時２ | ③ お前は･･･許さん！ | （+6） | ||
| ④ 何が目的だ | （+2） | |||
| ステージクリア時 | ⑤ 気を許しすぎていた････ | （+4） | 最大（80） | |
| ⑥ 悪い夢のようだ。 | （+2） | 最低（33） | ||
| Mission No.24 『その先にあるもの』 | ||||
| Mission No.25 『終局の地』 | ||||
| 遺跡奥での ライバル出現時 |
① そうかもしれない･･･ | （+2） | 最大（87） | |
| ② 国など関係ない。 | （+7） | 最低（35） | ||
| ステージクリア時 | ① そうだな･･･ やっと、終わった･･･ （※ そのままエンディングへ） |
※ ライバル出現前に最初のデススティンガーを倒すとエンディング? | ||
| ② しかし･･･払った犠牲は大きい （※ ステージ26へ） |
※ （50ポイント）以下だと②選択でもエンディング? | |||
| Mission No.26 『破滅を撒くもの』 | ||||
