| 番 号 | 道府県 | 市町村 | 地区名称 | 種別 | 選定年月日 | 選定 基準 | 面積 (ha) | 
| 1 | 北海道 | 函館市 | 元町末広町 | 港町 | 平成1.4.21 | (三) | 14.5 | 
| 2 | 青森県 | 弘前市 | 仲町 | 武家町 | 昭和53.5.31 | (二) | 10.6 | 
| 3 | 黒石市 | 中町 | 商家町 | 平成17.7.22 | (一) | 3.1 | |
| 4 | 岩手県 | 金ヶ崎町 | 城内諏訪小路 | 武家町 | 平成13.6.15 | (三) | 34.8 | 
| 5 | 秋田県 | 仙北市 | 角館 | 武家町 | 昭和51.9.4 | (二) | 6.9 | 
| 6 | 福島県 | 下郷町 | 大内宿 | 宿場町 | 昭和56.4.18 | (三) | 11.3 | 
| 7 | 群馬県 | 中之条町 | 赤岩 | 山村 養蚕集落 | 平成18.7.5 | (三) | 63.0 | 
| 8 | 埼玉県 | 川越市 | 川越 | 商家町 | 平成11.12.1 | (一) | 7.8 | 
| 9 | 千葉県 | 香取市 | 佐原 | 商家町 | 平成8.12.10 | (三) | 7.1 | 
| 10 | 新潟県 | 佐渡市 | 宿根木 | 港町 | 平成3.4.30 | (三) | 28.5 | 
| 11 | 富山県 | 高岡市 | 山町筋 | 商家町 | 平成12.12.4 | (一) | 5.5 | 
| 12 | 南砺市 | 相倉 | 山村集落 | 平成6.12.21 | (三) | 18.0 | |
| 13 | 菅沼 | 山村集落 | 平成6.12.21 | (三) | 4.4 | ||
| 14 | 石川県 | 金沢市 | 東山ひがし | 茶屋町 | 平成13.11.14 | (一) | 1.8 | 
| 15 | 主計町 | 茶屋町 | 平成20.6.9 | (一) | 0.6 | ||
| 16 | 加賀市 | 加賀橋立 | 船主集落 | 平成17.12.27 | (二) | 11.0 | |
| 17 | 輪島市 | 黒島地区 | 船主集落 | 平成21.6.30 | (二) | 20.5 | |
| 18 | 福井県 | 若狭町 | 熊川宿 | 宿場町 | 平成8.7.9 | (三) | 10.8 | 
| 19 | 小浜市 | 小浜西組 | 商家町 茶屋町 | 平成20.6.9 | (二) | 19.1 | |
| 20 | 山梨県 | 早川町 | 赤沢 | 山村 講中宿 | 平成5.7.14 | (三) | 25.6 | 
| 21 | 長野県 | 東御市 | 海野宿 | 宿場 養蚕町 | 昭和62.4.28 | (一) | 13.2 | 
| 22 | 南木曽町 | 妻籠宿 | 宿場町 | 昭和51.9.4 | (三) | 1245.4 | |
| 23 | 塩尻市 | 奈良井 | 宿場町 | 昭和53.5.31 | (三) | 17.6 | |
| 24 | ~ | 木曾平沢 | 漆工町 | 平成18.7.5 | (二) | 12.5 | |
| 25 | 白馬村 | 青鬼 | 山村集落 | 平成12.12.4 | (三) | 59.7 | |
| 26 | 岐阜県 | 高山市 | 三町 | 商家町 | 昭和54.2.3 | (一) | 4.4 | 
| 27 | 下二之町大新町 | 商家町 | 平成16.7.6 | (一) | 6.6 | ||
| 28 | 美濃市 | 美濃町 | 商家町 | 平成11.5.13 | (一) | 9.3 | |
| 29 | 恵那市 | 岩村町本通り | 商家町 | 平成10.4.17 | (三) | 14.6 | |
| 30 | 白川村 | 荻町 | 山村集落 | 昭和51.9.4 | (三) | 45.6 | |
| 31 | 三重県 | 亀山市 | 関宿 | 宿場町 | 昭和59.12.10 | (三) | 25.0 | 
| 32 | 滋賀県 | 大津市 | 坂本 | 里坊群 門前町 | 平成9.10.31 | (三) | 28.7 | 
| 33 | 近江八幡市 | 八幡 | 商家町 | 平成3.4.30 | (一) | 13.1 | |
| 34 | 東近江市 | 五個荘金堂 | 農村集落 | 平成10.12.25 | (三) | 32.3 | |
| 35 | 京都府 | 京都市 | 上賀茂 | 社家町 | 昭和63.12.16 | (三) | 2.7 | 
| 36 | 産寧坂 | 門前町 | 昭和51.9.4 | (三) | 8.2 | ||
| 37 | 祇園新橋 | 茶屋町 | 昭和51.9.4 | (一) | 1.4 | ||
| 38 | 嵯峨鳥居本 | 門前町 | 昭和54.5.21 | (三) | 2.6 | ||
| 39 | 南丹市 | 美山町北 | 山村集落 | 平成5.12.8 | (三) | 127.5 | |
| 40 | 伊根町 | 伊根浦 | 漁村 | 平成17.7.22 | (三) | 310.2 | |
| 41 | 与謝野町 | 加悦 | 製織町 | 平成17.12.27 | (二) | 12.0 | |
| 42 | 大阪府 | 富田林市 | 富田林 | 寺内町 在郷町 | 平成9.10.31 | (一) | 11.2 | 
| 43 | 兵庫県 | 神戸市 | 北野町山本通 | 港町 | 昭和55.4.10 | (一) | 9.3 | 
| 44 | 篠山市 | 篠山 | 城下町 | 平成16.12.10 | (二) | 40.2 | |
| 45 | 豊岡市 | 出石 | 城下町 | 平成19.12.4 | (二) | 23.1 | |
| 46 | 奈良県 | 橿原市 | 今井町 | 寺内町 在郷町 | 平成5.12.8 | (一) | 17.4 | 
| 47 | 宇陀市 | 松山 | 商家町 | 平成18.7.5 | (一) | 17.0 | |
| 48 | 和歌山県 | 湯浅町 | 湯浅 | 醸造町 | 平成18.12.19 | (二) | 6.3 | 
| 49 | 鳥取県 | 倉吉市 | 打吹玉川 | 商家町 | 平成10.12.25 | (一) | 4.7 | 
| 50 | 島根県 | 大田市 | 大森銀山 | 鉱山町 | 昭和62.12.5 | (三) | 162.7 | 
| 51 | 温泉津 | 港町 温泉町 | 平成16.7.6 | (二) | 36.6 | ||
| 52 | 岡山県 | 倉敷市 | 倉敷川畔 | 商家町 | 昭和54.5.21 | (一) | 15.0 | 
| 53 | 高梁市 | 吹屋 | 鉱山町 | 昭和52.5.18 | (三) | 6.4 | |
| 54 | 広島県 | 竹原市 | 竹原地区 | 製塩町 | 昭和57.12.16 | (一) | 5.0 | 
| 55 | 呉市 | 豊町御手洗 | 港町 | 平成6.7.4 | (二) | 6.9 | |
| 56 | 山口県 | 萩市 | 堀内地区 | 武家町 | 昭和51.9.4 | (二) | 77.4 | 
| 57 | 萩市 | 平安古地区 | 武家町 | 昭和51.9.4 | (二) | 4.0 | |
| 58 | 萩市 | 浜崎町 | 港町 | 平成13.11.14 | (二) | 10.3 | |
| 59 | 柳井市 | 古市金屋 | 商家町 | 昭和59.12.10 | (一) | 1.7 | |
| 60 | 徳島県 | 美馬市 | 脇町南町 | 商家町 | 昭和63.12.16 | (一) | 5.3 | 
| 61 | 三好市 | 東祖谷山村落合 | 山村集落 | 平成17.12.27 | (三) | 32.3 | |
| 62 | 香川県 | 丸亀市 | 塩飽本島町笠島 | 港町 | 昭和60.4.13 | (三) | 13.1 | 
| 63 | 愛媛県 | 内子町 | 八日市護国 | 製蝋町 | 昭和57.4.17 | (三) | 3.5 | 
| 64 | 西予市 | 宇和町卯之町 | 在郷町 | 平成21.10.16 | (二) | 4.9 | |
| 65 | 高知県 | 室戸市 | 吉良川町 | 在郷町 | 平成9.10.31 | (一) | 18.3 | 
| 66 | 福岡県 | 朝倉市 | 秋月 | 城下町 | 平成10.4.17 | (二) | 58.6 | 
| 67 | 八女市 | 八女福島 | 商家町 | 平成14.5.23 | (二) | 19.8 | |
| 68 | うきは市 | 筑後吉井 | 在郷町 | 平成8.12.10 | (三) | 20.7 | |
| 69 | 黒木町 | 黒木 | 在郷町 | 平成21.6.30 | (三) | 18.4 | |
| 70 | 佐賀県 | 有田町 | 有田内山 | 製磁町 | 平成3.4.30 | (三) | 15.9 | 
| 71 | 嬉野市 | 塩田津 | 商家町 | 平成17.12.27 | (二) | 12.8 | |
| 72 | 鹿島市 | 浜庄津町浜金屋町 | 港町 在郷町 | 平成18.7.5 | (二) | 2.0 | |
| 73 | 浜中町八本木宿 | 醸造町 | 平成18.7.5 | (一) | 6.7 | ||
| 74 | 長崎県 | 長崎市 | 東山手 | 港町 | 平成3.4.30 | (二) | 7.5 | 
| 75 | 南山手 | 港町 | 平成3.4.30 | (二) | 17.0 | ||
| 76 | 雲仙市 | 神代小路 | 武家町 | 平成17.7.22 | (二) | 9.8 | |
| 77 | 平戸市 | 大島村神浦 | 港町 | 平成20.6.9 | (二) | 21.2 | |
| 78 | 大分県 | 日田市 | 豆田町 | 商家町 | 平成16.12.10 | (二) | 10.7 | 
| 79 | 宮崎県 | 日南市 | 飫肥 | 武家町 | 昭和52.5.18 | (二) | 19.8 | 
| 80 | 日向市 | 美々津 | 港町 | 昭和61.12.8 | (二) | 7.2 | |
| 81 | 椎葉村 | 十根川 | 山村集落 | 平成10.12.25 | (三) | 39.9 | |
| 82 | 鹿児島県 | 出水市 | 出水麓 | 武家町 | 平成7.12.26 | (二) | 43.8 | 
| 83 | 薩摩川内市 | 入来麓 | 武家町 | 平成15.12.25 | (二) | 19.2 | |
| 84 | 知覧町 | 知覧 | 武家町 | 昭和56.11.30 | (二) | 18.6 | |
| 85 | 沖縄県 | 渡名喜村 | 渡名喜島 | 島の農村集落 | 平成12.5.25 | (三) | 21.4 | 
| 86 | 竹富町 | 竹富島 | 島の農村集落 | 昭和62.4.28 | (三) | 38.3 |